RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ISCA2Q86U28 154 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PLPP6Q8IY26 295 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A12Q96S37 553 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 FAM117AQ9C073 453 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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HERC4-211ENST00000492996 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CCDC167Q9P0B6 97 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SEPT3Q9UH03 358 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CIDEBQ9UHD4 219 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TMED5Q9Y3A6 229 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 A0A0J9YVX5 310 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 C9JVG2 144 aa6.95□□□□□ -1.3
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HERC4-211ENST00000492996 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 RHOBTB1O94844 696 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 GFAPP14136 432 aa6.95□□□□□ -1.3
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HERC4-211ENST00000492996 TWF1Q12792 350 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SPATA24Q86W54 205 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CARNMT1Q8N4J0 409 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 IRF7Q92985 503 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ESAMQ96AP7 390 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 FEM1CQ96JP0 617 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 RANBP9Q96S59 729 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SPATA16Q9BXB7 569 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PDFQ9HBH1 243 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 S100A14Q9HCY8 104 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PLK2Q9NYY3 685 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PRRG1O14668 218 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 NPHS1O60500 1241 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ACAP2Q15057 778 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ANGPT1Q15389 498 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 INAQ16352 499 aa6.94□□□□□ -1.3
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HERC4-211ENST00000492996 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.94□□□□□ -1.3
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
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HERC4-211ENST00000492996 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 MAGEH1Q9H213 219 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ADA2Q9NZK5 511 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.94□□□□□ -1.3
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HERC4-211ENST00000492996 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PTPRBP23467 1997 aa6.94□□□□□ -1.3
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HERC4-211ENST00000492996 H0Y626 953 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 INSIG1O15503 277 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 OR1I1O60431 355 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 NDUFS3O75489 264 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SRP72O76094 671 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
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HERC4-211ENST00000492996 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CDH4P55283 916 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 OR4D1Q15615 310 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TRIP10Q15642 601 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PTPRNQ16849 979 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 MMEL1Q495T6 779 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 VITQ6UXI7 678 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PIANPQ8IYJ0 282 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PSKH2Q96QS6 385 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 KCNA7Q96RP8 456 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SH3GL1Q99961 368 aa6.94□□□□□ -1.3
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