RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465848.1

DEGS1-204, Transcript of delta 4-desaturase, sphingolipid 1, humanhuman

TSL 2

Gene DEGS1, Length 633 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEGS1-204ENST00000465848 UNGP13051 313 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
DEGS1-204ENST00000465848 EPORP19235 508 aa3.47□□□□□ -1.85
DEGS1-204ENST00000465848 CCNA2P20248 432 aa3.47□□□□□ -1.85
DEGS1-204ENST00000465848 MYF6P23409 242 aa3.47□□□□□ -1.85
DEGS1-204ENST00000465848 NR2F2P24468 414 aa3.47□□□□□ -1.85
DEGS1-204ENST00000465848 NMBRP28336 390 aa3.47□□□□□ -1.85
DEGS1-204ENST00000465848 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
DEGS1-204ENST00000465848 GABRA5P31644 462 aa3.47□□□□□ -1.85
DEGS1-204ENST00000465848 CBSP35520 551 aa3.47□□□□□ -1.85
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DEGS1-204ENST00000465848 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
DEGS1-204ENST00000465848 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP3.47□□□□□ -1.85
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DEGS1-204ENST00000465848 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
DEGS1-204ENST00000465848 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
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DEGS1-204ENST00000465848 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa3.47□□□□□ -1.85
DEGS1-204ENST00000465848 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
DEGS1-204ENST00000465848 CASC4Q6P4E1 433 aa3.47□□□□□ -1.85
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DEGS1-204ENST00000465848 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
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DEGS1-204ENST00000465848 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
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DEGS1-204ENST00000465848 WDR20Q8TBZ3 569 aa3.47□□□□□ -1.85
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DEGS1-204ENST00000465848 OTULINQ96BN8 352 aa3.47□□□□□ -1.85
DEGS1-204ENST00000465848 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
DEGS1-204ENST00000465848 ERLEC1Q96DZ1 483 aa3.47□□□□□ -1.85
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DEGS1-204ENST00000465848 VPS39Q96JC1 886 aa3.47□□□□□ -1.85
DEGS1-204ENST00000465848 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa3.47□□□□□ -1.85
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DEGS1-204ENST00000465848 SMC6Q96SB8 1091 aa3.47□□□□□ -1.85
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DEGS1-204ENST00000465848 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
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DEGS1-204ENST00000465848 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
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DEGS1-204ENST00000465848 H7C1Q1 480 aa3.46□□□□□ -1.86
DEGS1-204ENST00000465848 RHODO00212 210 aa3.46□□□□□ -1.86
DEGS1-204ENST00000465848 HSPB6O14558 160 aa3.46□□□□□ -1.86
DEGS1-204ENST00000465848 INPPL1O15357 1258 aa3.46□□□□□ -1.86
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DEGS1-204ENST00000465848 TOMM70O94826 608 aa3.46□□□□□ -1.86
DEGS1-204ENST00000465848 PLAUP00749 431 aa3.46□□□□□ -1.86
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DEGS1-204ENST00000465848 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.86
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DEGS1-204ENST00000465848 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
DEGS1-204ENST00000465848 SLC39A14Q15043 492 aa3.46□□□□□ -1.86
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DEGS1-204ENST00000465848 INAQ16352 499 aa3.46□□□□□ -1.86
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DEGS1-204ENST00000465848 UGCGQ16739 394 aa3.46□□□□□ -1.86
DEGS1-204ENST00000465848 FAM153CQ494X1 144 aa3.46□□□□□ -1.86
DEGS1-204ENST00000465848 ENTPD8Q5MY95 495 aa3.46□□□□□ -1.86
DEGS1-204ENST00000465848 NCAPH2Q6IBW4 605 aa3.46□□□□□ -1.86
DEGS1-204ENST00000465848 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa3.46□□□□□ -1.86
DEGS1-204ENST00000465848 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa3.46□□□□□ -1.86
DEGS1-204ENST00000465848 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa3.46□□□□□ -1.86
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