RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 AVILO75366 819 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 TCEA3O75764 348 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM63AO94886 807 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 CRTAMO95727 393 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 F7P08709 466 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 CCL4P13236 92 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 MGAT1P26572 445 aa6.88□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1CAP62136 330 aa6.88□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 CES3Q6UWW8 571 aa6.88□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.88□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 MPP5Q8N3R9 675 aa6.88□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 SNX12Q9UMY4 172 aa6.88□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 ATMQ13315 3056 aa6.87□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 EFSO43281 561 aa6.87□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 TYRP1P17643 537 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 MSH3P20585 1137 aa6.87□□□□□ -1.31
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RABGEF1-206ENST00000461017 SQSTM1Q13501 440 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNJ11Q14654 390 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 RPE65Q16518 533 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 METRNLQ641Q3 311 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 WASH2PQ6VEQ5 465 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.87□□□□□ -1.31
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