RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267328.4

RAB20-201, Transcript of RAB20, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB20, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20-201ENST00000267328 ZNF549Q6P9A3 640 aa23.27■■□□□ 1.32
RAB20-201ENST00000267328 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
RAB20-201ENST00000267328 ASCL5Q7RTU5 278 aa23.27■■□□□ 1.32
RAB20-201ENST00000267328 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
RAB20-201ENST00000267328 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
RAB20-201ENST00000267328 RHOJQ9H4E5 214 aa23.27■■□□□ 1.32
RAB20-201ENST00000267328 TXNDC16Q9P2K2 825 aa23.27■■□□□ 1.32
RAB20-201ENST00000267328 SPASTQ9UBP0 616 aa23.27■■□□□ 1.32
RAB20-201ENST00000267328 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 KLHL33A6NCF5 533 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 SCAMP1O15126 338 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 KCNJ13O60928 360 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 POP7O75817 140 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 FTH1P02794 183 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 CTSEP14091 401 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 PRRT3Q5FWE3 981 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 DCLK2Q8N568 766 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 MINDY1Q8N5J2 469 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 GPBAR1Q8TDU6 330 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 PANX3Q96QZ0 392 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 RBBP8Q99708 897 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 CCDC68Q9H2F9 335 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 IL21RQ9HBE5 538 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 GULP1Q9UBP9 304 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 SLC23A2Q9UGH3 650 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 ST14Q9Y5Y6 855 aa23.26■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 PRR19A6NJB7 356 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 ACP5P13686 325 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 CCT8P50990 548 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 CLCNKAP51800 687 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 CTBSQ01459 385 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 DMPKQ09013 629 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 INSCQ1MX18 579 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 GRTP1Q5TC63 336 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 AMZ2Q86W34 360 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 OR2L2Q8NH16 312 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 SLC44A1Q8WWI5 657 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 CCM2Q9BSQ5 444 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 TSSK1BQ9BXA7 367 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 FETUBQ9UGM5 382 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa23.25■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 MGAT4DA6NG13 374 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 IQCF5A8MTL0 148 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 ZNF883P0CG24 379 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 ABCG1P45844 678 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 ARHGAP8P85298 464 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 ELOCQ15369 112 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 PRR23CQ6ZRP0 262 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 NRROSQ86YC3 692 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 OR2I1PQ8NGU4 316 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 CCL4L1Q8NHW4 92 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 KCNJ9Q92806 393 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 VPS39Q96JC1 886 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 PAFAH2Q99487 392 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 GSDMCQ9BYG8 508 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 MED16Q9Y2X0 877 aa23.24■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 AQP9O43315 295 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 NIPSNAP2O75323 286 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 NUDT17P0C025 328 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 DGKAP23743 735 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 LIMK2P53671 638 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 BNIP3Q12983 259 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 C1orf61Q13536 156 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 KRT222Q8N1A0 295 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 HM13Q8TCT9 377 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 LMX1AQ8TE12 382 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 DHRS4Q9BTZ2 278 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 SDC3O75056 442 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 FAM155BO75949 473 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 VCLP18206 1134 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 CD9P21926 228 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 AK4P27144 223 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 SPRP35270 261 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 IL9RQ01113 521 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 FAM45BPQ6NSW5 357 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 XKR5Q6UX68 686 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 FAM45AQ8TCE6 357 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 SAP25Q8TEE9 199 aa23.23■■□□□ 1.31
RAB20-201ENST00000267328 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms