RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 CD68P34810 354 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CDKL1Q00532 357 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ECT2LQ008S8 904 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 GNA12Q03113 381 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 PCID2Q5JVF3 399 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 HACD2Q6Y1H2 254 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 HM13Q8TCT9 377 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ACDQ96AP0 544 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM245Q9H330 911 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 PACSIN3Q9UKS6 424 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CEPT1Q9Y6K0 416 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ILVBLA1L0T0 632 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC34A8MYJ7 566 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 K7ERQ8 282 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 H6PDO95479 791 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 STMN1P16949 149 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC7A1P30825 629 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNT4Q8N4A0 578 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 NPWQ8N729 165 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ITFG2Q969R8 447 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 BIRC8Q96P09 236 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 IER2Q9BTL4 223 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 PNPLA3Q9NST1 481 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNT8Q9NY28 637 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS51Q9UID3 782 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CKAP5Q14008 2032 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 SDHDO14521 159 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ALDH3B2P48448 385 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK9P50750 372 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CARM1Q86X55 608 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TSGA13Q96PP4 275 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM86C1Q9NVL1 165 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ADA2Q9NZK5 511 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 HEATR9A2RTY3 570 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 STAMBPO95630 424 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 EPHX1P07099 455 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 NFKB1P19838 968 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 NMBRP28336 390 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 EOGTQ5NDL2 527 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD4Q8WVF5 259 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 MYRFQ9Y2G1 1151 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 EML5Q05BV3 1969 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CBX4O00257 560 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPKAPK2P49137 400 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 FNTBP49356 437 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 OLIG2Q13516 323 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM198Q66K66 360 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CACUL1Q86Y37 369 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CROCCP3Q8IVE0 287 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIML2Q8N7C3 387 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 MDGA1Q8NFP4 955 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR78Q96P69 363 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CCT7Q99832 543 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TPSD1Q9BZJ3 242 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP13A1Q9HD20 1204 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 XPR1Q9UBH6 696 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR179Q6PRD1 2367 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 WASH4PA8MWX3 477 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK4P11802 303 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ARF5P84085 180 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 IL23RQ5VWK5 629 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 PACRGLQ8N7B6 248 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ACVR1CQ8NER5 493 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 HMCESQ96FZ2 354 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 PREBQ9HCU5 417 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SPAG4Q9NPE6 437 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 CD93Q9NPY3 652 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 IRAK4Q9NWZ3 460 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO4Q9UKT5 387 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 RAMP2O60895 175 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 LRP8Q14114 963 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 IL31Q6EBC2 164 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SDE2Q6IQ49 451 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM45BPQ6NSW5 357 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 TSTD1Q8NFU3 115 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM45AQ8TCE6 357 aa26■■□□□ 1.75
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