RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039744.12

Lnx1-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Lnx1, Length 2,727 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1-201ENSMUST00000039744 TiprlQ8BH58 271 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Sept11Q8C1B7 431 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gm6367Q8C6L9 287 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Phtf2Q8CB19 747 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Trmt6Q8CE96 497 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Mrpl48Q8JZS9 211 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Angptl7Q8R1Q3 337 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Hacd2Q9D3B1 254 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Actl11Q9D5V1 1207 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 1700034I23RikQ9D9Q3 184 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Rrn3B2RS91 656 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ccnb1ip1D3Z3K2 276 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Vmn2r61L7N2B8 865 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Sypl2O89104 264 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 CtswP56203 371 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Cry1P97784 606 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Apoa1Q00623 264 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Pdcd1Q02242 288 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Sox9Q04887 507 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Cyp2c65Q148B1 490 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Uimc1Q5U5Q9 727 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Dtx4Q6PDK8 616 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Rad9bQ6WBX7 403 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Adam39Q7M762 756 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Letm2Q7TNU7 480 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Znf786Q8BV42 777 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Lpcat2Q8BYI6 544 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Hdac7Q8C2B3 938 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Rbm14Q8C2Q3 669 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ccdc90bQ8C3X2 256 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Fcho1Q8K285 873 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ddx18Q8K363 660 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Slc13a3Q91Y63 600 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Them5Q9CQJ0 248 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Cpxm2Q9D2L5 764 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Q9D4W2 315 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Plscr2Q9DCW2 307 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Tspan3Q9QY33 253 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ror1Q9Z139 937 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Plxnb3Q9QY40 1902 aa11.97□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Prpmp5E9PXN1 296 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gm17175E9Q528 179 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 PrkcaP20444 672 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Faf2Q3TDN2 445 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Stt3bQ3TDQ1 823 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 PkdccQ5RJI4 492 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ndrg1Q62433 394 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Nomo1Q6GQT9 1214 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Magee1Q6PCZ4 918 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 SgtaQ8BJU0 315 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Tmem209Q8BRG8 561 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Fam78aQ8C552 283 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Atxn7l2Q8C8K6 696 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Pcdhb2Q91Y00 799 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Twf1Q91YR1 350 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Arpc2Q9CVB6 300 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Fbxl20Q9CZV8 436 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 CabyrQ9D424 453 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Cyp4v2Q9DBW0 525 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Smpd3Q9JJY3 655 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gm29133A0A1B0GT72 266 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Fam171a2A2A699 822 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ces1bD3Z5G7 567 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Lilra5D3Z7A9 295 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Pgbd1E9Q492 415 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Sema3aO08665 772 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Slc30a4O35149 430 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Slc1a6O35544 561 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 NoctO35710 429 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Aif1O70200 147 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 NrlP54846 237 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 YwhazP63101 245 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Sox4Q06831 440 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Dtx3lQ3UIR3 748 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 6430531B16RikQ3V2J1 307 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 BadQ61337 204 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 BC061212Q6P8K3 481 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Lrfn2Q80TG9 788 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 NfascQ810U3 1240 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gprc5aQ8BHL4 356 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Zmiz2Q8CIE2 920 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gsto2Q8K2Q2 248 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ahi1Q8K3E5 1047 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Fndc5Q8K4Z2 209 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Prpsap2Q8R574 369 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Vps11Q91W86 941 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Krcc1Q99JT5 256 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Nudt8Q9CR24 210 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 IqchQ9D2K4 1071 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 PllpQ9DCU2 182 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 CtsmQ9JL96 333 aa11.96□□□□□ -0.49
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gm13089A2AGW7 455 aa11.95□□□□□ -0.5
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Slc25a54B1AUS6 473 aa11.95□□□□□ -0.5
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Akap5D3YVF0 745 aa11.95□□□□□ -0.5
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Ccdc8D3YZV8 685 aa11.95□□□□□ -0.5
Lnx1-201ENSMUST00000039744 Gm5478D3Z6R0 159 aa11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 73.8 ms