RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zc3h7aE9PWW6 970 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 E9Q0B3 247 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rab11fip2G3XA57 512 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pik3r2O08908 722 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 ChadO55226 358 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp6v0d1P51863 351 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp5jP97450 108 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mat2aQ3THS6 395 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hk3Q3TRM8 922 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Naa11Q3UX61 218 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defa-rs10Q64263 91 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smpd4Q6ZPR5 823 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rps27lQ6ZWY3 84 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 CpmQ80V42 443 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf879Q8BI99 563 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 LnpepQ8C129 1025 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr398Q8VFY0 314 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Elp2Q91WG4 831 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 NgrnQ99KS2 293 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 StambpQ9CQ26 424 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clca1Q9D7Z6 913 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Isca2Q9DCB8 154 aa11.63□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm4871D3Z0W7 314 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ech1O35459 327 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01679 107 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mcpt2P15119 244 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klkb1P26262 638 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 PdgfbP31240 241 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pim3P58750 326 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Shox2P70390 331 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 PrkcqQ02111 707 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sox4Q06831 440 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd36Q08857 472 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eps15l1Q60902 907 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Itih3Q61704 889 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 MregQ6NVG5 214 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prickle2Q80Y24 845 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Elmo1Q8BPU7 727 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Exd2Q8VEG4 650 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nipal2Q91WC7 383 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppil1Q9D0W5 166 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam174aQ9D3L0 190 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Speer3W4VSP1 261 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm7173A0A0G2JEB6 3132 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 FanceB8JJD6 213 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nccrp1G3X9C2 266 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gata5P97489 404 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif2dQ61211 570 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Itih1Q61702 907 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Irf4Q64287 450 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 BegainQ68EF6 600 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kiss1Q6Y4S4 130 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trappc6aQ78XR0 159 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr664Q7TRP5 306 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mppe1Q80XL7 396 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim14Q8BVW3 440 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Osbpl6Q8BXR9 959 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 4932414N04RikQ8CEQ9 752 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abcf3Q8K268 709 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hbp1Q8R316 516 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tex9Q9D845 387 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdcd7Q9WTY1 482 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rbck1Q9WUB0 508 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gbp2Q9Z0E6 589 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr620E9PZ66 313 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3594E9Q2A7 267 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adh6aE9Q5Z6 375 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prr22F6TNE3 422 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Syn1O88935 706 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp1b2P14231 290 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pou4f1P17208 421 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 PrtgQ2EY15 1191 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp57Q8C6P8 421 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acap1Q8K2H4 740 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 ClpsQ9CQC2 113 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 DynapQ9D7M5 161 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dtwd1Q9D8U7 304 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mfap5Q9QZJ6 164 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 OtofQ9ESF1 1997 aa11.62□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r22E9Q7S8 853 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Neurod4O09105 330 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lhx1P63006 406 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Qsox2Q3TMX7 692 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Shcbp1lQ3TTP0 639 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 CcnjlQ5SRT8 387 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Six3Q62233 333 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp606Q7TSV0 794 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem74Q8BQU7 305 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 LctlQ8K1F9 566 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ints10Q8K2A7 710 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cops8Q8VBV7 209 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1176Q8VG40 315 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Creb3l4Q9D2A5 370 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fzd5Q9EQD0 585 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc5a3Q9JKZ2 718 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc25a13Q9QXX4 676 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cst9Q9Z0H6 137 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igkv6-29A0A0G2JEI6 115 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tex13aA2AFS9 377 aa11.61□□□□□ -0.55
Herc3-201ENSMUST00000031823 Proca1B0QZF7 307 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.3 ms