RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Actl7aQ9QY84 440 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PrebQ9WUQ2 417 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm45713A0A1B0GS68 446 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Smim17A0A504 109 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kcnt2D3Z649 1135 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 GmlE9PX31 176 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm21915J3QPM7 133 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PnpP23492 289 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cd247P24161 164 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ppm1bP36993 390 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NadkP58058 439 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tnks2Q3UES3 1166 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vps72Q62481 368 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nup62Q63850 526 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Carns1Q6ZPS2 827 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm6377Q8BHV4 303 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc17a6Q8BLE7 582 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Adi1Q99JT9 179 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pak1ip1Q9DCE5 382 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc5a3Q9JKZ2 718 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Enthd1E9Q1Z2 618 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nlrp12E9Q5R7 1054 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm3248K7N721 186 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dpy19l2P0CW70 773 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Colec11Q3SXB8 272 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Opa3Q505D7 179 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 FaddQ61160 205 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 DazlQ64368 298 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ino80dQ66JY2 873 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 BC080695Q66JY9 481 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PapolgQ6PCL9 739 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Taf1cQ6PDZ2 836 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Chst8Q8BQ86 417 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Taf5Q8C092 801 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Atxn7l2Q8C8K6 696 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 DutQ8VCG1 200 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 WacQ924H7 646 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kif19Q99PT9 997 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nipsnap3bQ9CQE1 247 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ppil6Q9D6D8 278 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ptk2bQ9QVP9 1009 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Smok1Q9QYZ4 484 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 RbpmsQ9WVB0 197 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Bcl10Q9Z0H7 233 aa8.87□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nup210lQ9D2F7 1881 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4933424G06RikA0A140LIP3 267 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rrn3B2RS91 656 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm4788E9Q8B5 879 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm10338K7N692 204 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm3187M0QWW3 260 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ifnar2O35664 513 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Scg3P47867 471 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hpcal1P62748 193 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Clec12aQ504P2 267 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cldn11Q60771 207 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Chi3l1Q61362 389 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr855Q7TRF8 312 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ChfrQ810L3 664 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MaobQ8BW75 520 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 HnrnplQ8R081 586 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr589Q8VGV8 317 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rnf144aQ925F3 292 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rsph14Q9D3W1 341 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc34a2Q9DBP0 697 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wnk1P83741 2377 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ddx43D3Z6P9 646 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 AlyrefO08583 255 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prkag1O54950 330 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 LdhcP00342 332 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Psmb9P28076 219 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rab12P35283 243 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Guca1aP43081 202 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Aqp4P55088 323 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gabrb3P63080 473 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 TankP70347 448 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Txnl4aP83877 142 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Smad5P97454 465 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lypla1P97823 230 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmc5Q32NZ6 967 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rbbp7Q60973 425 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cd300lfQ6SJQ7 337 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Armc12Q80X86 340 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Reps2Q80XA6 521 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf410Q8BKX7 478 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cpne3Q8BT60 533 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 C1qtnf7Q8BVD7 289 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 D630039A03RikQ8K0M7 236 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fbxw7Q8VBV4 629 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Akr1c21Q91WR5 323 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Npffr2Q924H0 417 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ProzQ9CQW3 399 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cldn22Q9D7U6 220 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cables1Q9ESJ1 568 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Scnn1gQ9WU39 655 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Padi3Q9Z184 664 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Col6a6Q8C6K9 2265 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam171a2A2A699 822 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa8.86□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hs3st1O35310 311 aa8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.7 ms