RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570103.5

CFDP1-209, Transcript of craniofacial development protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CFDP1, Length 663 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1-209ENST00000570103 ZNF69Q9UC07 566 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 FZD4Q9ULV1 537 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 PLXNA2O75051 1894 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-209ENST00000570103 SMCO2A6NFE2 343 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 J3KRW8 73 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 SLC28A2O43868 658 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 GJB3O75712 270 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 CALM1P0DP23 149 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 CALM2P0DP24 149 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 CALM3P0DP25 149 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 CPA1P15085 419 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 MATN1P21941 496 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 DUSP1P28562 367 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 MCM2P49736 904 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 RARRES1P49788 294 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 AGTR2P50052 363 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 CSRP3P50461 194 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 ARPP19P56211 112 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 TRPC3Q13507 836 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 RUNX3Q13761 415 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 NAB2Q15742 525 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 FAM153CQ494X1 144 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 AWAT1Q58HT5 328 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 SPDYCQ5MJ68 293 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 TPGS2Q68CL5 300 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 WDR93Q6P2C0 686 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 SLC27A1Q6PCB7 646 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 RINLQ6ZS11 566 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 RABEPKQ7Z6M1 372 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 TMC8Q8IU68 726 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 FSIP1Q8NA03 581 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 RNF149Q8NC42 400 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 NCOA7Q8NI08 942 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 OLIG1Q8TAK6 271 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 RLN3Q8WXF3 142 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 HTRA1Q92743 480 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 TMEM143Q96AN5 459 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 P2RY13Q9BPV8 354 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 REEP2Q9BRK0 252 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 ADGRE3Q9BY15 652 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 NOD2Q9HC29 1040 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 HPS4Q9NQG7 708 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 ADAM21Q9UKJ8 722 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 ITPR3Q14573 2671 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 FLNCQ14315 2725 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 LRRK2Q5S007 2527 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 LRRK1Q38SD2 2015 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 FAM149AA5PLN7 773 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 VWA3AA6NCI4 1184 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 A6NLC8 198 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 E9PAM4 449 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 I3L4J1 428 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 PTGESO14684 152 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 MSH4O15457 936 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 ASAP2O43150 1006 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 RRP8O43159 456 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 KLK10O43240 276 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 TRAPPC3O43617 180 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 B3GAT3O94766 335 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 PRAMEF12O95522 483 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 LYL1P12980 280 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 ACP5P13686 325 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 HLA-EP13747 358 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 XBP1P17861 261 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 NDUFS1P28331 727 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 SLC8A1P32418 973 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 P2RY2P41231 377 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 BRCC3P46736 316 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 CLCNKBP51801 687 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 PTENP60484 403 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 ANKRD1Q15327 319 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 ATG16L1Q676U5 607 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 PLA2G4FQ68DD2 849 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 CD300LGQ6UXG3 332 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 TRIM72Q6ZMU5 477 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 BBS12Q6ZW61 710 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 TMTC3Q6ZXV5 915 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 ANO5Q75V66 913 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 MIER3Q7Z3K6 550 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 AMIGO2Q86SJ2 522 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-209ENST00000570103 FRMD1Q8N878 549 aa4.89□□□□□ -1.63
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