RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550446.5

LETMD1-224, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 562 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-224	ENST00000550446	NOMO1	Q15155	1222 aa		18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	IGFBP7	Q16270	282 aa		18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	COLEC12	Q5KU26	742 aa		18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	IRGC	Q6NXR0	463 aa		18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	RSC1A1	Q92681	617 aa		18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	VPS35	Q96QK1	796 aa		18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	IL26	Q9NPH9	171 aa		18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	POT1	Q9NUX5	634 aa		18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	CROT	Q9UKG9	612 aa		18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		18.62	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	PRR19	A6NJB7	356 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446		F5H423	210 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	UGT1A9	O60656	530 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	KIAA0754	O94854	1291 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	NDUFA10	O95299	355 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	UGT1A6	P19224	532 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	UGT1A1	P22309	533 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	UGT1A4	P22310	534 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	WNT3A	P56704	352 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	SEPT6	Q14141	434 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	ERV3-1	Q14264	604 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC14A2	Q15849	920 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	KAZN	Q674X7	775 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		18.61	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	MAST4	O15021	2626 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	CBFA2T2	O43439	604 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	SPOP	O43791	374 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	CST8	O60676	142 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	TPM1	P09493	284 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	COMT	P21964	271 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	HMGCL	P35914	325 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	CASR	P41180	1078 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	HAL	P42357	657 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC1A1	P43005	524 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	CAPZB	P47756	277 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	NR2C2	P49116	596 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	TRIM14	Q14142	442 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	CHRNA6	Q15825	494 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	AMZ2	Q86W34	360 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		18.6	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	SPAG6	O75602	509 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	NFKB1	P19838	968 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	CDKN2B	P42772	138 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	CHRNA4	P43681	627 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	WASHC5	Q12768	1159 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	TFDP2	Q14188	446 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	PPP2R5E	Q16537	467 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	KDELC1	Q6UW63	502 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	PID1	Q7Z2X4	250 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	TRABD	Q9H4I3	376 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	PADI1	Q9ULC6	663 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	KCTD3	Q9Y597	815 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		18.59	■□□□□ 0.57
LETMD1-224	ENST00000550446	KCNJ13	O60928	360 aa		18.58	■□□□□ 0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	FURIN	P09958	794 aa		18.58	■□□□□ 0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	FGF5	P12034	268 aa		18.58	■□□□□ 0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	PPP1CA	P62136	330 aa		18.58	■□□□□ 0.56
LETMD1-224	ENST00000550446	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms