RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 NOL4O94818 638 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 C2P06681 752 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF846Q147U1 533 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SPIN4Q56A73 249 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF311Q5JNZ3 666 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 BICRALQ6AI39 1079 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SLC38A4Q969I6 547 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 HMCESQ96FZ2 354 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 TTYH3Q9C0H2 523 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 DAPK2Q9UIK4 370 aa8.42□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 KCNJ13O60928 360 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 IL12RB1P42701 662 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 HDDC2Q7Z4H3 204 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SERPINA9Q86WD7 417 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.42□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.42□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 ENO4A6NNW6 628 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 NPPAP01160 153 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 TNFP01375 233 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CASRP41180 1078 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 GPM6BQ13491 265 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 AAK1Q2M2I8 961 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 MSANTD2Q6P1R3 559 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF567Q8N184 647 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 C15orf40Q8WUR7 153 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf74Q96LT6 269 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PTGFRNQ9P2B2 879 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 VGLL3A8MV65 326 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 XKRYO14609 159 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 EPHB6O15197 1021 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SLC16A5O15375 505 aa8.42□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 UGT2B4P06133 528 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SF1Q15637 639 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ADGRF1Q5T601 910 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PAMR1Q6UXH9 720 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 KRT77Q7Z794 578 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 VEGFDO43915 354 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 IFNW1P05000 195 aa8.41□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CNSTQ6PJW8 725 aa8.41□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 OXR1Q8N573 874 aa8.41□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 SERPINA3P01011 423 aa8.41□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 FUKQ8N0W3 1084 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 LCN9Q8WX39 176 aa8.41□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 COMMD9Q9P000 198 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 YIPF1Q9Y548 306 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 FAM234BA2RU67 622 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 RIIAD1A6NNX1 92 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 WNT9AO14904 365 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PRKAR1AP10644 381 aa8.41□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 ELNP15502 786 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 GNAZP19086 355 aa8.41□□□□□ -1.06
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