RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 FUT11Q495W5 492 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 TIGD2Q4W5G0 525 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 DLEU7Q6UYE1 221 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 NECAB2Q7Z6G3 386 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 DTWD1Q8N5C7 304 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 TEX26Q8N6G2 289 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 SETD9Q8NE22 299 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 OR56A4Q8NGH8 313 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 OR5K1Q8NHB7 308 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 TEX37Q96LM6 180 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 CTRCQ99895 268 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 HGH1Q9BTY7 390 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 CPNE5Q9HCH3 593 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 RNF112Q9ULX5 631 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 ERVK-11Q9UQG0 969 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 MYBPHLA2RUH7 354 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 PPP6CO00743 305 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 PTGESO14684 152 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 AREL1O15033 823 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 MSI1O43347 362 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 RPP40O75818 363 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 SCELO95171 688 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 MT-ND1P03886 318 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 TCF3P15923 654 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 MSH3P20585 1137 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 ACVR2AP27037 513 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 CXCR4P61073 352 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 ISL1P61371 349 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 MVKQ03426 396 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 RAD51Q06609 339 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 PHKG1Q16816 387 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 DPY19L1Q2PZI1 675 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 ZNF792Q3KQV3 632 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 NOMO2Q5JPE7 1267 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 SULF1Q8IWU6 871 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 FAR1Q8WVX9 515 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 YIPF6Q96EC8 236 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 YIPF2Q9BWQ6 316 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 SIK2Q9H0K1 926 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 RNF39Q9H2S5 420 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 ABCC13Q9NSE7 274 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 TMEM30AQ9NV96 361 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 ERVW-1Q9UQF0 538 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 IPPQ9Y573 584 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 LRRC14BA6NHZ5 514 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 M0R3G1 203 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 KPNA6O60684 536 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 SLC4A1P02730 911 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 FGF1P05230 155 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 MMP2P08253 660 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 HLA-DPA1P20036 260 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 CD9P21926 228 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 IL12AP29459 219 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 CD40LGP29965 261 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 CD86P42081 329 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 KCNAB2Q13303 367 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 INAQ16352 499 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 MEP1AQ16819 746 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 IMPG1Q17R60 797 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 SMU1Q2TAY7 513 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 SIRPB2Q5JXA9 342 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 C6orf136Q5SQH8 315 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 MARC1Q5VT66 337 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 TUBA3EQ6PEY2 450 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 SYVN1Q86TM6 617 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 ADHFE1Q8IWW8 467 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 HOMEZQ8IX15 550 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 LGI2Q8N0V4 545 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 EID3Q8N140 333 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 SVOPQ8N4V2 548 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-202ENST00000542324 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms