RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 DOK1Q99704 481 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 CCSER2Q9H7U1 834 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 SPC25Q9HBM1 224 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 CD274Q9NZQ7 290 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 SEPT3Q9UH03 358 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 IL2P60568 153 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 CPNE9Q8IYJ1 553 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 SOCS4Q8WXH5 440 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 SPON2Q9BUD6 331 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 DYTNA2CJ06 578 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 F5H5T6 163 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 PRLP01236 227 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 ARPP19P56211 112 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 GNA12Q03113 381 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 CTXN3Q4LDR2 81 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 C17orf99Q6UX52 265 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 ZFAND4Q86XD8 727 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 BPIFB1Q8TDL5 484 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 LINGO1Q96FE5 620 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 NSMCE2Q96MF7 247 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 NOD1Q9Y239 953 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 SH3PXD2BA1X283 911 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 ERVPABLB-1P60509 514 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-221ENST00000511747 INSIG1O15503 277 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 DLEU7Q6UYE1 221 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 RIMKLAQ8IXN7 391 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 DPP10Q8N608 796 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 THAP11Q96EK4 314 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 B3GALT6Q96L58 329 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 PPM1MQ96MI6 270 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 MAGEH1Q9H213 219 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 NTN4Q9HB63 628 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ASGR1P07306 291 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 NEDD8Q15843 81 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 CLLU1OSQ5K130 101 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 CTSL3PQ5NE16 218 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM26Q6ZUK4 368 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 CD200R1Q8TD46 325 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 MUS81Q96NY9 551 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF382Q96SR6 550 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 PLXNA3P51805 1871 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PPW3 197 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 H0YAE9 185 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 TTPAP49638 278 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 HLCSP50747 726 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 TGFBIQ15582 683 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 FGD3Q5JSP0 725 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 SFRP1Q8N474 314 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 LEMD2Q8NC56 503 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 MIPOL1Q8TD10 442 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 HBEGFQ99075 208 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM45AQ9NWC5 275 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 H0Y858 1186 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 TLR5O60602 858 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ALBP02768 609 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 LPOP22079 712 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC6A4P31645 630 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 MC4RP32245 332 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 LETMD1Q6P1Q0 360 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 DTWD1Q8N5C7 304 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 METTL6Q8TCB7 284 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 NUDT8Q8WV74 236 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 TLR9Q9NR96 1032 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 FKBPLQ9UIM3 349 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 G6PDP11413 515 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 CDH1P12830 882 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 MTPNP58546 118 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 SELPLGQ14242 412 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 BPIFA1Q9NP55 256 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 B4GAT1O43505 415 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 CYBAP13498 195 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 PSMA3P25788 255 aa26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms