RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 OR52A4PA6NMU1 304 aa22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNJ13O60928 360 aa22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 RASSF9O75901 435 aa22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF28P17035 718 aa22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SEPHS1P49903 392 aa22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 GTF2H3Q13889 308 aa22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 GPR18Q14330 331 aa22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 KLHL6Q8WZ60 621 aa22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 RSC1A1Q92681 617 aa22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 ZDHHC12Q96GR4 267 aa22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 KCTD3Q9Y597 815 aa22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SPTBP11277 2137 aa22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 CBFA2T2O43439 604 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 EPOP01588 193 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 F8A1P23610 371 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 DRG2P55039 364 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SH3BP2P78314 561 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SEPT6Q14141 434 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 C16orf46Q6P387 395 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 GDAP1Q8TB36 358 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC42Q96M95 316 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 BPIFA1Q9NP55 256 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 UBP1Q9NZI7 540 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TRDMT1-211ENST00000495022 CYSRT1A8MQ03 144 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 MTSS1O43312 755 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 NDUFA10O95299 355 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 TPM1P09493 284 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 FGF5P12034 268 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 CD68P34810 354 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 DLSTP36957 453 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 HALP42357 657 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 CDKN2BP42772 138 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 DMPKQ09013 629 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 TFDP2Q14188 446 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 TCEAL1Q15170 157 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 TAZQ16635 292 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 CACHD1Q5VU97 1274 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 KDELC1Q6UW63 502 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 RASGRP3Q8IV61 690 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 TTC30BQ8N4P2 665 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 GALNT6Q8NCL4 622 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 ABHD17AQ96GS6 310 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 TTC25Q96NG3 672 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 CHP1Q99653 195 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 IL26Q9NPH9 171 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 HACD3Q9P035 362 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 CROTQ9UKG9 612 aa22.13■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 KIAA0754O94854 1291 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 NELFEP18615 380 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 WNT3AP56704 352 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 WASHC5Q12768 1159 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 SEMA5BQ9P283 1151 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 KCND3Q9UK17 655 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 INTUQ9ULD6 942 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR37Q9Y2I8 494 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 MED13Q9UHV7 2174 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 SPOPO43791 374 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 NFKB1P19838 968 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 SPAM1P38567 509 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 FOXK1P85037 733 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 SIRPB2Q5JXA9 342 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 COLEC12Q5KU26 742 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 LDLRAP1Q5SW96 308 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 IRGCQ6NXR0 463 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM92BQ6ZTR7 304 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 AMZ2Q86W34 360 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP1R3BQ86XI6 285 aa22.12■■□□□ 1.13
TRDMT1-211ENST00000495022 IL17CQ9P0M4 197 aa22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms