RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 TTC1Q99614 292 aa16.59■□□□□ 0.25
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RABGEF1-204ENST00000442563 TREX1Q9NSU2 369 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 RABGEF1Q9UJ41 708 aa16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC78A2IDD5 438 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 MGAT4DA6NG13 374 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 RHPN2P1A8MT19 583 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SGTAO43765 313 aa16.58■□□□□ 0.24
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RABGEF1-204ENST00000442563 MGAT1P26572 445 aa16.58■□□□□ 0.24
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RABGEF1-204ENST00000442563 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 FNBP1LQ5T0N5 605 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC9B2Q86UD5 537 aa16.58■□□□□ 0.24
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RABGEF1-204ENST00000442563 KLHL7Q8IXQ5 586 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 PIANPQ8IYJ0 282 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC37A2Q8TED4 501 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 PATE1Q8WXA2 126 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SH3KBP1Q96B97 665 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 DEPDC7Q96QD5 511 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRN3Q9H3W5 708 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
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RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 KNTC1P50748 2209 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 ASXL3Q9C0F0 2248 aa16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM149AA5PLN7 773 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SDR42E2A6NKP2 422 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2AG2A6NM03 316 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 PPM1DO15297 605 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 B4GAT1O43505 415 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SNX2O60749 519 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 AP2A2O94973 939 aa16.57■□□□□ 0.24
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RABGEF1-204ENST00000442563 IVDP26440 423 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGEA3P43357 314 aa16.57■□□□□ 0.24
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RABGEF1-204ENST00000442563 CCL7P80098 99 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 DR1Q01658 176 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 GSTM4Q03013 218 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SQSTM1Q13501 440 aa16.57■□□□□ 0.24
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RABGEF1-204ENST00000442563 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
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RABGEF1-204ENST00000442563 SPRED1Q7Z699 444 aa16.57■□□□□ 0.24
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RABGEF1-204ENST00000442563 OR6P1Q8NGX9 317 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2L2Q8NH16 312 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 GATA6Q92908 595 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SERPINB12Q96P63 405 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SYBUQ9NX95 663 aa16.57■□□□□ 0.24
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RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa16.57■□□□□ 0.24
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RABGEF1-204ENST00000442563 OR51F1A6NGY5 319 aa16.56■□□□□ 0.24
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RABGEF1-204ENST00000442563 CRADDP78560 199 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SPIDRQ14159 915 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 ISXQ2M1V0 245 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 DET1Q7L5Y6 550 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 JAMLQ86YT9 394 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 SPATA4Q8NEY3 305 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 UCK1Q9HA47 277 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 CPNE7Q9UBL6 633 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 ACSL5Q9ULC5 683 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 PTPRBP23467 1997 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 PDZK1P1A8MUH7 402 aa16.55■□□□□ 0.24
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