RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369547.5

SYT6-201, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT6, Length 4,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-201ENST00000369547 NOBOXO60393 691 aa16■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 IMPDH1P20839 514 aa16■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 FEN1P39748 380 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 RPS9P46781 194 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 SPIBQ01892 262 aa16■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 DGUOKQ16854 277 aa16■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 SPANXN2Q5MJ10 180 aa16■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 AGMOQ6ZNB7 445 aa16■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 FAM124AQ86V42 546 aa16■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 CFAP206Q8IYR0 622 aa16■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 NELL1Q92832 810 aa16■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 AMBNQ9NP70 447 aa16■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 ABCB8Q9NUT2 735 aa16■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa16■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 TRIM43BA6NCK2 446 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 SNTNA6NMZ2 147 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 E7ESA3 106 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 H3BM21 787 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 hCG_2039718K7EN88 272 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 CLDN9O95484 217 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 ACRP10323 421 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 NR2F1P10589 423 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 CCNA2P20248 432 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 CCNFP41002 786 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 XIAPP98170 497 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 CCDC157Q569K6 752 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 CPTPQ5TA50 214 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 NPAS4Q8IUM7 802 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 EPHX4Q8IUS5 362 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 CLIP3Q96DZ5 547 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 PHF12Q96QT6 1004 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 RAD21L1Q9H4I0 556 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 GPSM3Q9Y4H4 160 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 A0A1W2PRU2 124 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 EI24O14681 340 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 SUV39H1O43463 412 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 OR10H3O60404 316 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 MED26O95402 600 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 EOMESO95936 686 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 ADGRE1Q14246 886 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 KRT78Q8N1N4 520 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 PSMA8Q8TAA3 256 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 AP2M1Q96CW1 435 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 PNPLA8Q9NP80 782 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 ECI2O75521 394 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 INHAP05111 366 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 POU2F1P14859 743 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 SLC6A2P23975 617 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 GKP32189 559 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 NR1D2Q14995 579 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 IFNL1Q8IU54 200 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 TADA1Q96BN2 335 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 DNAJC11Q9NVH1 559 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 KLHL3Q9UH77 587 aa15.99■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 MFN2O95140 757 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 CSKP41240 450 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 HERVK_113P63132 956 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 MS4A13Q5J8X5 152 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 NPWQ8N729 165 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 TMEM74Q96NL1 305 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 ERVK-6Q9BXR3 956 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 MYH1P12882 1939 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 FAM25AB3EWG3 89 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 FAM25CB3EWG5 89 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 FAM25GB3EWG6 89 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 SEC24AO95486 1093 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 ESR1P03372 595 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 TNNI3P19429 210 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 HTR7P34969 479 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 MPPE1Q53F39 396 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 DEF8Q6ZN54 512 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 PKP2Q99959 881 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 KLHL1Q9NR64 748 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 TOR4AQ9NXH8 423 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 ISM1B1AKI9 464 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 FKTNO75072 461 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 TRMUO75648 421 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 AOC1P19801 751 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 PTGER3P43115 390 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 HCAR3P49019 387 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 EPS8Q12929 822 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 RABL3Q5HYI8 236 aa15.98■□□□□ 0.15
SYT6-201ENST00000369547 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms