RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SNAP91O60641 907 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 VAPBO95292 243 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 RHOCP08134 193 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 NXNQ6DKJ4 435 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 CNTN4Q8IWV2 1026 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 AGR3Q8TD06 166 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 MRGPRX3Q96LB0 322 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTL7AQ9Y615 435 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 STON1Q9Y6Q2 735 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-201ENST00000246533 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PQF6 199 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 SBK3P0C264 359 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF23P17027 643 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 RHOQP17081 205 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ERCC2P18074 760 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 NTSR1P30989 418 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ACVRL1P37023 503 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 PKNOX1P55347 436 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TPI1P60174 286 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 HPCAP84074 193 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CRY1Q16526 586 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 EFHD1Q9BUP0 239 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 MUC3BQ9H195 1237 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM248Q9NWD8 314 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 APPL1Q9UKG1 709 aa26.08■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CHD5Q8TDI0 1954 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TK2O00142 265 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TDGF1P13385 188 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 GMPRP36959 345 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 RANBP1P43487 201 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CCR3P51677 355 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBA4AP68366 448 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNT2Q10471 571 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 MAMSTRQ6ZN01 415 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 LSMEM2Q8N112 164 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 EME1Q96AY2 570 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC126Q96EE4 140 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 OCEL1Q9H607 264 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 AP4S1Q9Y587 144 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 MT-CO1P00395 513 aa26.06■■□□□ 1.76
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CAPNS1-201ENST00000246533 RHDQ02161 417 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CERCAMQ5T4B2 595 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf52Q5T4I8 152 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CHSY3Q70JA7 882 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TP53INP2Q8IXH6 220 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM1BQ8NB78 822 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A17Q9H1V8 727 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A087X1B8 175 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ATG13O75143 517 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V1B1P15313 513 aa26.06■■□□□ 1.76
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CAPNS1-201ENST00000246533 PELI3Q8N2H9 469 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPAN14Q8NG11 270 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 MIPOL1Q8TD10 442 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL32Q96NJ5 620 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CHRAC1Q9NRG0 131 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
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CAPNS1-201ENST00000246533 TRMUO75648 421 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXB2P14652 356 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 DPP6P42658 865 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 PLK1P53350 603 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB10P61026 200 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 PSME3P61289 254 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ENPP2Q13822 863 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 SQLEQ14534 574 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 IYDQ6PHW0 289 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 LINGO4Q6UY18 593 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TEKT5Q96M29 485 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 GABRG3Q99928 467 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 SPON2Q9BUD6 331 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC8A2Q9UPR5 921 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVW-1Q9UQF0 538 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 DLX3O60479 287 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-201ENST00000246533 SP9P0CG40 484 aa26.04■■□□□ 1.76
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