RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpr143P70259 405 aa9.86□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prdx5P99029 210 aa9.86□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eml4Q3UMY5 988 aa9.86□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp868Q3UTQ6 422 aa9.86□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ndrg1Q62433 394 aa9.86□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mfn2Q80U63 757 aa9.86□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SynbQ8BI41 618 aa9.86□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fbxo44Q8BK26 255 aa9.86□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gtse1Q8R080 741 aa9.86□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Akr1c13Q8VC28 323 aa9.86□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mrps18bQ99N84 254 aa9.86□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ppp6cQ9CQR6 305 aa9.86□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Snap29Q9ERB0 260 aa9.86□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc6a14Q9JMA9 638 aa9.86□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Orc6Q9WUJ8 262 aa9.86□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dpp6Q9Z218 804 aa9.86□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mcf2A2AEU1 1111 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zcchc7B1AX39 541 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm4302E9PX25 294 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8237E9Q257 205 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Matn4O89029 624 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MndaP0DOV1 425 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 F3P20352 294 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TubP50586 505 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Polr3bP59470 1133 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kcnj13P86046 360 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ermp1Q3UVK0 898 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc27a5Q4LDG0 689 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 BC061212Q6P8K3 481 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Magee1Q6PCZ4 918 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rsbn1Q80T69 795 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 A730061H03RikQ8BGD2 154 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kctd13Q8BGV7 329 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gsdmc3Q8CB12 480 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ifi205aQ8CGE8 404 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc38a4Q8R1S9 547 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gtf2a1lQ8R4I4 468 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ndufa5Q9CPP6 116 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q9CPZ3 230 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GhrlQ9EQX0 117 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bmp15Q9Z0L4 392 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lgr4A2ARI4 951 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mup13L7N222 235 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nrp2O35375 931 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Znf143O70230 638 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hoxa2P31245 372 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tnfsf4P43488 198 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kcnj12P52187 427 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Apoa1Q00623 264 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pros1Q08761 675 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 St8sia4Q64692 359 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prmt6Q6NZB1 378 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Efr3aQ8BG67 819 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccdc142Q8CAI1 738 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prmt5Q8CIG8 637 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tnfaip8Q921Z5 198 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MrrfQ9D6S7 262 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc28a3Q9ERH8 703 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tbkbp1A2A9T0 611 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Polr2jO08740 117 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tuba1bP05213 451 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ugt2b17P17717 530 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il6raP22272 460 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hoxa10P31310 416 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tuba1aP68369 451 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Afap1l2Q5DTU0 825 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trpc1Q61056 793 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rapgefl1Q68EF8 662 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 KdsrQ6GV12 332 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Znf821Q6PD05 413 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1062Q7TR71 315 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sytl5Q80T23 753 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tecpr1Q80VP0 1166 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 BspryQ80YW5 473 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rap2aQ80ZJ1 183 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Elmod2Q8BGF6 293 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sephs1Q8BH69 392 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pgs1Q8BHF7 553 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nt5dc1Q8C5P5 467 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q8K207 121 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cbx7Q8VDS3 158 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ugt2b38Q91WH2 530 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Chid1Q922Q9 393 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dok4Q99KE3 325 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atp6v1c2Q99L60 427 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Riok2Q9CQS5 547 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pou5f2Q9DAC9 329 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vps35Q9EQH3 796 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PollQ9QXE2 573 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fbxo16Q9QZM9 334 aa9.85□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cacna1cQ01815 2139 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1049A2ARZ0 308 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RbpjlO08674 515 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Itgb3O54890 787 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dmp1O55188 503 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tbxas1P36423 533 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arf4P61750 180 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.1 ms