RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRTM4Q86VH4 590 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRN4Q8WUT4 740 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL6Q8WZ60 621 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 CASS4Q9NQ75 786 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ANO10Q9NW15 660 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 AMACRQ9UHK6 382 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRG1Q9Y653 693 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC10BA6NIK2 292 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ARGFXA6NJG6 315 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52A4PA6NMU1 304 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 CD48P09326 243 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 CD86P42081 329 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR18Q14330 331 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 THAP4Q8WY91 577 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 BTBD6Q96KE9 485 aa26.9■■□□□ 1.9
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CAPNS1-217ENST00000629983 GPR89BP0CG08 455 aa26.89■■□□□ 1.9
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CAPNS1-217ENST00000629983 IL4RP24394 825 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL4DP49703 201 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 DRG2P55039 364 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
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CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 GALNT3Q14435 633 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 UGT8Q16880 541 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 DTLQ9NZJ0 730 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD66B4E2M5 251 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 MTX2O75431 263 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF224P0DH78 156 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 IDSP22304 550 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 CCNCP24863 283 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE1BQ01064 536 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNAB1Q14722 419 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 GLYATL1Q969I3 302 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 TIMM29Q9BSF4 260 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR87Q9BY21 358 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC40A1Q9NP59 571 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 LUZP4Q9P127 313 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 IP6K2Q9UHH9 426 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 ANAPC7Q9UJX3 599 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 SHOC2Q9UQ13 582 aa26.88■■□□□ 1.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 PTPN4P29074 926 aa26.87■■□□□ 1.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 GPR26Q8NDV2 337 aa26.87■■□□□ 1.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 PIRTP0C851 137 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 SKILP12757 684 aa26.86■■□□□ 1.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1CAP62136 330 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 STX1AQ16623 288 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 HADHQ16836 314 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 SYVN1Q86TM6 617 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC30BQ8N4P2 665 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 UBXN4Q92575 508 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 NUP85Q9BW27 656 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC29A3Q9BZD2 475 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 RAD18Q9NS91 495 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 EPHA6Q9UF33 1036 aa26.86■■□□□ 1.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK14O94921 469 aa26.85■■□□□ 1.89
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CAPNS1-217ENST00000629983 HALP42357 657 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 ACY1Q03154 408 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 NIPA2Q8N8Q9 360 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 TSGA13Q96PP4 275 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 MFRPQ9BY79 579 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR63Q9BZJ6 419 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 ISCUQ9H1K1 167 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 SLAMF7Q9NQ25 335 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 AIPL1Q9NZN9 384 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 JCHAINP01591 159 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-217ENST00000629983 EBLN1P0CF75 366 aa26.84■■□□□ 1.89
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