RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	MTPN	P58546	118 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	TAS2R39	P59534	338 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	DCDC1	P59894	354 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF460	Q14592	562 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	GRIK4	Q16099	956 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	MON1B	Q7L1V2	547 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC185	Q8N715	623 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PIK3R3	Q92569	461 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	NTS	P30990	170 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	FMO3	P31513	532 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	JAM2	P57087	298 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CAPS	Q13938	189 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CACUL1	Q86Y37	369 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	DAW1	Q8N136	415 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	IL31RA	Q8NI17	732 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC115	Q96NT0	180 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	OR52B2	Q96RD2	323 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	MUC13	Q9H3R2	512 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	VPS4A	Q9UN37	437 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ADRA1B	P35368	520 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC15A1	P46059	708 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PCDH1	Q08174	1060 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CHIA	Q9BZP6	476 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	GLOD4	Q9HC38	313 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC22A1	O15245	554 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	DYRK3	O43781	588 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	MFSD11	O43934	449 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	TULP3	O75386	442 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	TSC22D1	Q15714	1073 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ZBTB6	Q15916	424 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CYP1B1	Q16678	543 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	USP30	Q70CQ3	517 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	DNER	Q8NFT8	737 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ATL1	Q8WXF7	558 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	TP53INP1	Q96A56	240 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ROPN1L	Q96C74	230 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	AGAP2	Q99490	1192 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	RHBG	Q9H310	441 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	SPON1	Q9HCB6	807 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF536	O15090	1300 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	NFASC	O94856	1347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CLDN5	O00501	218 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ITM2A	O43736	263 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	YES1	P07947	543 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PTP4A2	Q12974	167 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CCL15	Q16663	113 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	QRFPR	Q96P65	431 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	HSPB11	Q9Y547	144 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PIP5K1B	O14986	540 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	MID1	O15344	667 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	EGFR	P00533	1210 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	FOSL2	P15408	326 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	DEFA5	Q01523	94 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	DAG1	Q14118	895 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	GNA13	Q14344	377 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	GRIK5	Q16478	980 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FAM200B-223	ENST00000622362	PDSS2	Q86YH6	399 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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