RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620099.1

SNORD39.4-201, humanhuman

BASIC

Gene SNORD39, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD39.4-201ENST00000620099 Q6ZPA2 131 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 RFX8Q6ZV50 586 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 RTL10Q7L3V2 364 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 STRADAQ7RTN6 431 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 MAATS1Q7Z4T9 603 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPR149Q86SP6 731 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM110Q86TL2 294 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PALB2Q86YC2 1186 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 LDLRAD3Q86YD5 345 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 MAP7D3Q8IWC1 876 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 IZUMO1Q8IYV9 350 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ARHGAP18Q8N392 663 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 MMGT1Q8N4V1 131 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 EXD1Q8NHP7 514 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC26Q8TAB7 109 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 DNAJB14Q8TBM8 379 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 SPPL2BQ8TCT7 592 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 OSCP1Q8WVF1 389 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TEKT4Q8WW24 435 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ATRIPQ8WXE1 791 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 RSC1A1Q92681 617 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLCO2A1Q92959 643 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 CD101Q93033 1021 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 RSPRY1Q96DX4 576 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PCDHB18PQ96TA0 734 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 FERMT1Q9BQL6 677 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 SYT15Q9BQS2 421 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 C11orf70Q9BRQ4 267 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 CNPY3Q9BT09 278 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 HTATIP2Q9BUP3 242 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 DUSP16Q9BY84 665 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TSPYL1Q9H0U9 437 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRPV6Q9H1D0 765 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 MYLK2Q9H1R3 596 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 FBXO44Q9H4M3 255 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 OBP2BQ9NPH6 170 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TBC1D13Q9NVG8 400 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 COMMD8Q9NX08 183 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 DONSONQ9NYP3 566 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 DNAJB11Q9UBS4 358 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRIM10Q9UDY6 481 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 SERTAD3Q9UJW9 196 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ADAM28Q9UKQ2 775 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ALG6Q9Y672 507 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa3.5□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 BRWD1Q9NSI6 2320 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 OR2W5A6NFC9 320 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 CASTOR2A6NHX0 329 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 UNC119BA6NIH7 251 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PSMD9O00233 223 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 SYT5O00445 386 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PIP5K1BO14986 540 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PRPSAP2O60256 369 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 DAB1O75553 588 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TJP3O95049 919 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ONECUT2O95948 504 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 FTCDO95954 541 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 GAS8O95995 478 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 VIPP01282 170 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ITGA2BP08514 1039 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ITGA5P08648 1049 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ITGAMP11215 1152 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PPP3CBP16298 524 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPD1P21695 349 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PSMA2P25787 234 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 UQCRC1P31930 480 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PPP3CCP48454 512 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PGDP52209 483 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ITGA8P53708 1063 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TLE2Q04725 743 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPS2Q13227 327 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 MPP3Q13368 585 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PLD1Q13393 1074 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 ATP1A4Q13733 1029 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 TFDP2Q14188 446 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 MESDQ14696 234 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 KCNAB1Q14722 419 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 PDK2Q15119 407 aa3.49□□□□□ -1.85
SNORD39.4-201ENST00000620099 USP41Q3LFD5 358 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms