RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 EPHB1P54762 984 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 IRF4Q15306 451 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 WSCD2Q2TBF2 565 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 MSS51Q4VC12 460 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RGS9BPQ6ZS82 235 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 Q6ZVL8 140 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 NEK10Q6ZWH5 1172 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM69Q86WT6 500 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ACTL9Q8TC94 416 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SCAMP4Q969E2 229 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 MGME1Q9BQP7 344 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 NBEAQ8NFP9 2946 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RP1P56715 2156 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TM7SF2O76062 418 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ITGAVP06756 1048 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ELFN1P0C7U0 828 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 T-ENOLP0DO92 83 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CHRNA4P43681 627 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RENBPP51606 427 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CRTC1Q6UUV9 634 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ARRDC2Q8TBH0 407 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PYROXD1Q8WU10 500 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM131CQ96AQ9 280 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 LGR4Q9BXB1 951 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 DCTN4Q9UJW0 460 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM149AA5PLN7 773 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 VILLO15195 856 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC7A4O43246 635 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP6V1G1O75348 118 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 GM2AP17900 193 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 RBL1P28749 1068 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 AKT2P31751 481 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 MMP12P39900 470 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC18A1P54219 525 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 NXPH1P58417 271 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 OVGP1Q12889 678 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 RALGDSQ12967 914 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 FNBP1LQ5T0N5 605 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 FAXCQ5TGI0 409 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC38Q5VT99 294 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 NLRP9Q7RTR0 991 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM13CQ8NE31 585 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 NUDCD1Q96RS6 583 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PAFAH2Q99487 392 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC24A2Q9UI40 661 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 H0Y3Z8 333 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP5HO75947 161 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 MMP2P08253 660 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 HOXD12P35452 270 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 HNF1BP35680 557 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PARP6Q2NL67 630 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ERAP2Q6P179 960 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 DOK6Q6PKX4 331 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 NAXDQ8IW45 347 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP12.45□□□□□ -0.426e-6■□□□□ 8.9
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC25A41Q8N5S1 370 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC35B2Q8TB61 432 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CPT1BQ92523 772 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 RABGEF1Q9UJ41 708 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 MGAQ8IWI9 3026 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 GPR39O43194 453 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TSPAN6O43657 245 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PEX11AO75192 247 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 USP12O75317 370 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 B3GALNT1O75752 331 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CLDN7O95471 211 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PRLP01236 227 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 NFKB1P19838 968 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 MX2P20592 715 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CCNCP24863 283 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PTPN3P26045 913 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CNGA3Q16281 694 aa12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms