RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586312.5

PSME3-208, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 5

Gene PSME3, Length 752 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-208	ENST00000586312	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	PPM1D	O15297	605 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	GRID2	O43424	1007 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	METTL18	O95568	372 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	ECEL1	O95672	775 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	MSH3	P20585	1137 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	ADRA1A	P35348	466 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	ACTR1B	P42025	376 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	ACTR1A	P61163	376 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	SPARCL1	Q14515	664 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	NR1D2	Q14995	579 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	INSC	Q1MX18	579 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	ZMYND15	Q9H091	742 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	IL17C	Q9P0M4	197 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-208	ENST00000586312	HEATR9	A2RTY3	570 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	KMO	O15229	486 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CDK14	O94921	469 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PRAMEF1	O95521	474 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	OR1D5	P58170	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CDK16	Q00536	496 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SEMA5A	Q13591	1074 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	POU6F1	Q14863	301 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PPP1R7	Q15435	360 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	LSMEM2	Q8N112	164 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF398	Q8TD17	642 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	STYX	Q8WUJ0	223 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	OR2AG1	Q9H205	316 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ASB8	Q9H765	288 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	IL26	Q9NPH9	171 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ARL5A	Q9Y689	179 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	KLHL33	A6NCF5	533 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	NUAK1	O60285	661 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	KCNJ13	O60928	360 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PHF2	O75151	1096 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CCKBR	P32239	447 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CA5A	P35218	305 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ABCG1	P45844	678 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	FNTA	P49354	379 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	INHBC	P55103	352 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TMPRSS15	P98073	1019 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CFHR1	Q03591	330 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CHRNA6	Q15825	494 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	GPR33	Q49SQ1	333 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	KCTD11	Q693B1	232 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PRORY	Q9H606	182 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	BFAR	Q9NZS9	450 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	RNF14	Q9UBS8	474 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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