RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNC4Q03721 635 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 GRIN2CQ14957 1233 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR4D1Q15615 310 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 LAYNQ6UX15 382 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 FUNDC1Q8IVP5 155 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 DEFB123Q8N688 67 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 CIB1Q99828 191 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 AKTIPQ9H8T0 292 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 EBF1Q9UH73 591 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 SOBPA7XYQ1 873 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYN3O14994 580 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 SOAT2O75908 522 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDK14O94921 469 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 CSPG5O95196 566 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 FGF4P08620 206 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 TAF10Q12962 218 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 TUBA1CQ9BQE3 449 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 CWH43Q9H720 699 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDFQ9HBH1 243 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 RIMKLBQ9ULI2 386 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 UBXN8O00124 270 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 CTNNB1P35222 781 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC36A3Q495N2 470 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 DHFR2Q86XF0 187 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR4L1Q8NH43 312 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 RHEBL1Q8TAI7 183 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 GIPC3Q8TF64 312 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 PHF12Q96QT6 1004 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 MID1IP1Q9NPA3 183 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCD2Q9UBJ2 740 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 BBIP1A8MTZ0 92 aa20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 SOCS2O14508 198 aa20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTHFD2P13995 350 aa20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 STC1P52823 247 aa20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 RING1Q06587 406 aa20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPRED1Q7Z699 444 aa20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATOH8Q96SQ7 321 aa20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 SMOXQ9NWM0 555 aa20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 EYSQ5T1H1 3165 aa20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 H3BMM5 538 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 PIRTP0C851 137 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERVK-21P61565 698 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 PFKFB4Q16877 469 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF19Q2TAC6 998 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 KANK2Q63ZY3 851 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRMT9Q6P2P2 845 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 TBC1D15Q8TC07 691 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 TWIST2Q8WVJ9 160 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADI1Q9BV57 179 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM15Q9C019 465 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRANK1O15050 2925 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC14BA6NHZ5 514 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 H3BMQ9 156 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP6CO00743 305 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 AZIN1O14977 448 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 STAMBPO95630 424 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 SERPINF2P08697 491 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 TACR2P21452 398 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC7A2P52569 658 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDH15P55291 814 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPR153Q6NV75 609 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 CYP2R1Q6VVX0 501 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 COG8Q96MW5 612 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF599Q96NL3 588 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 CXorf21Q9HAI6 301 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A0J9YYE9 177 aa20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 PIP5K1BO14986 540 aa20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1-205ENST00000564630 SERPINB7O75635 380 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms