RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa23.61■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 RLN3Q8WXF3 142 aa23.61■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 OLFM1Q99784 485 aa23.61■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 SLC13A1Q9BZW2 595 aa23.61■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa23.6■■□□□ 1.37
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MEIS3-204ENST00000558555 C2P06681 752 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 OR56A5P0C7T3 313 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 CHRM3P20309 590 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 CCT5P48643 541 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 B4GALNT1Q00973 533 aa23.6■■□□□ 1.37
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MEIS3-204ENST00000558555 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 KIAA0895LQ68EN5 471 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 UGT3A1Q6NUS8 523 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 SH2D5Q6ZV89 423 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM105Q8N8V8 129 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 DENND6BQ8NEG7 585 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 KCNJ9Q92806 393 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 CENPTQ96BT3 561 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
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MEIS3-204ENST00000558555 SPACA7Q96KW9 195 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 TSNARE1Q96NA8 513 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 GPR174Q9BXC1 333 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 POPDC3Q9HBV1 291 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
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MEIS3-204ENST00000558555 ACOT9Q9Y305 439 aa23.6■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 A0A087X1B8 175 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 K7ESF4 209 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 QSOX1O00391 747 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 AXIN1O15169 862 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 MTX2O75431 263 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 AP2A2O94973 939 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 INPP5AQ14642 412 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 PPM1JQ5JR12 505 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 HEATR4Q86WZ0 1026 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 BANPQ8N9N5 519 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 TSSK1BQ9BXA7 367 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 WDR26Q9H7D7 661 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 GPAMQ9HCL2 828 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 PRSS21Q9Y6M0 314 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 CACNA1HO95180 2353 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 LATO43561 262 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 NIPSNAP2O75323 286 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 FSBPO95073 299 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 CD9P21926 228 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 GTF2H3Q13889 308 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 DET1Q7L5Y6 550 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 PANX3Q96QZ0 392 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM39Q9HCM9 518 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 MKS1Q9NXB0 559 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 DCDC2Q9UHG0 476 aa23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM120BA0PK00 339 aa23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 RAD51BO15315 384 aa23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 SLC35E2BP0CK96 405 aa23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 AKT2P31751 481 aa23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 NUDT1P36639 197 aa23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 CDK3Q00526 305 aa23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF460Q14592 562 aa23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM74Q86UV6 250 aa23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 PIM3Q86V86 326 aa23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 FAM136AQ96C01 138 aa23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 GPR21Q99679 349 aa23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 FZD3Q9NPG1 666 aa23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa23.58■■□□□ 1.37
MEIS3-204ENST00000558555 FPGTO14772 594 aa23.57■■□□□ 1.36
MEIS3-204ENST00000558555 TYROBPO43914 113 aa23.57■■□□□ 1.36
MEIS3-204ENST00000558555 GLRA3O75311 464 aa23.57■■□□□ 1.36
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM16O95361 564 aa23.57■■□□□ 1.36
MEIS3-204ENST00000558555 COL6A2P12110 1019 aa23.57■■□□□ 1.36
MEIS3-204ENST00000558555 CRHR1P34998 444 aa23.57■■□□□ 1.36
MEIS3-204ENST00000558555 IGFALSP35858 605 aa23.57■■□□□ 1.36
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM23P36406 574 aa23.57■■□□□ 1.36
MEIS3-204ENST00000558555 CSRP3P50461 194 aa23.57■■□□□ 1.36
MEIS3-204ENST00000558555 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
MEIS3-204ENST00000558555 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
MEIS3-204ENST00000558555 COX14Q96I36 57 aa23.57■■□□□ 1.36
MEIS3-204ENST00000558555 MYOCQ99972 504 aa23.57■■□□□ 1.36
MEIS3-204ENST00000558555 TEX101Q9BY14 249 aa23.57■■□□□ 1.36
MEIS3-204ENST00000558555 VPS13AQ96RL7 3174 aa23.57■■□□□ 1.36
MEIS3-204ENST00000558555 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa23.57■■□□□ 1.36
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