RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552009.1

GNPTAB-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-209ENST00000552009 INAVAQ3KP66 663 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 GBP6Q6ZN66 633 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 BEND5Q7L4P6 421 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM131BQ86XD5 332 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 DRC7Q8IY82 874 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF683Q8IZ20 524 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 KDM1BQ8NB78 822 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 CFAP57Q96MR6 1250 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 NPY6RQ99463 290 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 RWDD2AQ9UIY3 292 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 ITM2BQ9Y287 266 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 APC2O95996 2303 aa6.99□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 PES1O00541 588 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 NRP2O60462 931 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 BRINP1O60477 761 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 CLDN11O75508 207 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 GAAP10253 952 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC2A3P11169 496 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 KRT10P13645 584 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 CYP11B1P15538 503 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 KRT9P35527 623 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 HNF1BP35680 557 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 PPP1R2P41236 205 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 ABCG1P45844 678 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 CXCR3P49682 368 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 CDH4P55283 916 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 OCRLQ01968 901 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 DEUP1Q05D60 604 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 SULT2A1Q06520 285 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 CCDC173Q0VFZ6 552 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC12A1Q13621 1099 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 FGL2Q14314 439 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 CDO1Q16878 200 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF284Q2VY69 593 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 C22orf39Q6P5X5 142 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 TMPRSS12Q86WS5 348 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 TRIM69Q86WT6 500 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 XYLT1Q86Y38 959 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 SKA1Q96BD8 255 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 NXPE2Q96DL1 559 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 TRIM62Q9BVG3 475 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 PDCL3Q9H2J4 239 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 WDCPQ9H6R7 721 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 ZMAT4Q9H898 229 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.98□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 A0A087WV48 116 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 POM121BA6NF01 834 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 E9PAM4 449 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM72CH0Y354 149 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 SCAMP1O15126 338 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 DFNA5O60443 496 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 C1QL1O75973 258 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 GIMD1P0DJR0 217 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 GYPEP15421 78 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 CKMT2P17540 419 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 DGKAP23743 735 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 RXRGP48443 463 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 NRG3P56975 720 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 ARF5P84085 180 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 MEA1Q16626 185 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-209ENST00000552009 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms