RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 RHPN2P1A8MT19 583 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 B4E171 279 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 CHUKO15111 745 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 NUAK1O60285 661 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 PMPCBO75439 489 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ECEL1O95672 775 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 THRAP10827 490 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 NFKB1P19838 968 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ALDH4A1P30038 563 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 TSPAN7P41732 249 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 WNT3AP56704 352 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 RWDD2BP57060 319 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 MPP3Q13368 585 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 DOK6Q6PKX4 331 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 SLC30A9Q6PML9 568 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 PID1Q7Z2X4 250 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 TRIM74Q86UV6 250 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 CCDC50Q8IVM0 306 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 TXLNBQ8N3L3 684 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 SFRP1Q8N474 314 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 FAM26EQ8N5C1 309 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 AGBL5Q8NDL9 886 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 GPR26Q8NDV2 337 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 CCDC112Q8NEF3 446 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 MRGPRX2Q96LB1 330 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 VPS35Q96QK1 796 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 DPYSL5Q9BPU6 564 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 OSBPL8Q9BZF1 889 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 GPR63Q9BZJ6 419 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 TRIM39Q9HCM9 518 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP11.38□□□□□ -0.595e-7■■■□□ 17.4
CS-221ENST00000550734 HACD3Q9P035 362 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 PDP2Q9P2J9 529 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 PILRAQ9UKJ1 303 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 SHOC2Q9UQ13 582 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ITPR2Q14571 2701 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ICE1Q9Y2F5 2266 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 A6NCN8 305 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 PRR19A6NJB7 356 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 PPM1DO15297 605 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 INPP4BO15327 924 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 RAD1O60671 282 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ASMTLO95671 621 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 BPIP17213 487 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 HLA-DPA1P20036 260 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ACTR1BP42025 376 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 CD97P48960 835 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 RAB15P59190 212 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ACTR1AP61163 376 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 LLGL1Q15334 1064 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 SLC1A5Q15758 541 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 PCSK7Q16549 785 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 FAM182AQ5T1J6 154 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 TTC30BQ8N4P2 665 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 BMPERQ8N8U9 685 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ACTL9Q8TC94 416 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ALG3Q92685 438 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ART4Q93070 314 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 GLYATL1Q969I3 302 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 C19orf43Q9BQ61 176 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 FERMT1Q9BQL6 677 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 HERPUD2Q9BSE4 406 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 HEMGNQ9BXL5 484 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 UBP1Q9NZI7 540 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ATXN10Q9UBB4 475 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 SPO11Q9Y5K1 396 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 CENPEQ02224 2701 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 OR5K4A6NMS3 321 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 AURKAO14965 403 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 NKX2-8O15522 239 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 GRID2O43424 1007 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 VEGFDO43915 354 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ANXA9O76027 345 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 TJP3O95049 919 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 PIRTP0C851 137 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 SLC2A4P14672 509 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 RBL1P28749 1068 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 CSF2RBP32927 897 aa11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms