RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 UBE2QL1A1L167 161 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CYB5AP00167 134 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CALCAP01258 141 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 RB1P06400 928 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 GIMD1P0DJR0 217 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 AGXTP21549 392 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 MASP1P48740 699 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF132P52740 706 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TAS2R50P59544 299 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 GMFBP60983 142 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ECT2LQ008S8 904 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 AAGABQ6PD74 315 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 AMZ2Q86W34 360 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 MBD2Q9UBB5 411 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 MAFFQ9ULX9 164 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA2Q9UM82 520 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 NRAPQ86VF7 1730 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 NEMP2A6NFY4 417 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SLC22A2O15244 555 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PRAMEF1O95521 474 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ESR1P03372 595 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 UGT2B4P06133 528 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 LYNP07948 512 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 FAM153BP0C7A2 387 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 NR2F6P10588 404 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 NRG3P56975 720 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PSME3P61289 254 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CTBP1Q13363 440 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SMCO1Q147U7 214 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 EXOC2Q96KP1 924 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SUSD3Q96L08 255 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SCML2Q9UQR0 700 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 KCPQ6ZWJ8 1503 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PEX11AO75192 247 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PRPS2P11908 318 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CDH3P22223 829 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CDKN2BP42772 138 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 DGKGP49619 791 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ACLYP53396 1101 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 JAM2P57087 298 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CAMK1Q14012 370 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SNX20Q7Z614 316 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 FAM124AQ86V42 546 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 HIPK1Q86Z02 1210 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PRELID2Q8N945 189 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CPXM1Q96SM3 734 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CFL2Q9Y281 166 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SQORQ9Y6N5 450 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TTC3P53804 2025 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TFPIP10646 304 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 APLP1P51693 650 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 KLHL26Q53HC5 615 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 MOB2Q70IA6 237 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 HMCESQ96FZ2 354 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF347Q96SE7 839 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SNPHO15079 494 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 NRP2O60462 931 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ADH5P11766 374 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ALAS2P22557 587 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 MPIP34949 423 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 USP46P62068 366 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 NEDD8Q15843 81 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ECM1Q16610 540 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 GPR152Q8TDT2 470 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 LCN9Q8WX39 176 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.34□□□□□ -1.39
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