RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516697.1

RNU6-180P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 180, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-180P, Length 61 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-180P-201ENST00000516697 RPP40O75818 363 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 STAM2O75886 525 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FAM155BO75949 473 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 DDHD2O94830 711 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TOXO94900 526 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CCNDBP1O95273 360 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CLPTM1O96005 669 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PNPP00491 289 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 VIPP01282 170 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 IGLV3-19P01714 112 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 IGHEP01854 428 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ANXA6P08133 673 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ITGA5P08648 1049 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CYP3A4P08684 503 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FAM106CPP0CH98 169 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PF4V1P10720 104 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ACP2P11117 423 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CYP4B1P13584 511 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ETFAP13804 333 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC2A4P14672 509 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 LIFP15018 202 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF823P16415 610 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CKMT2P17540 419 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 IGFBP2P18065 325 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SRD5A1P18405 259 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ACHEP22303 614 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GPX3P22352 226 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ITGA3P26006 1051 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PTPN3P26045 913 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 YWHAQP27348 245 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GDF1P27539 372 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PDHA2P29803 388 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TTKP33981 857 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 AHRP35869 848 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 USP8P40818 1118 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PSMC4P43686 418 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GPR12P47775 334 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 RGRP47804 291 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PCP4P48539 62 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 LIG4P49917 911 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CLCNKAP51800 687 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GUCY2FP51841 1108 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF136P52737 540 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 LBX1P52954 281 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 IST1P53990 364 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CACNB3P54284 484 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 OAZ1P54368 228 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC12A3P55017 1021 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TMEM50BP56557 158 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CLDN20P56880 219 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SORDQ00796 357 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC18A2Q05940 514 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FOXM1Q08050 763 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF543Q08ER8 600 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GALNT2Q10471 571 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GRIK3Q13003 919 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CDC16Q13042 620 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GAGE5Q13069 117 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GAGE6Q13070 117 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PRKAA1Q13131 559 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PDCLQ13371 301 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MTMR1Q13613 665 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ACVR2BQ13705 512 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ATP1A4Q13733 1029 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MOBPQ13875 183 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 LY6DQ14210 128 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF234Q14588 700 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 IL13RA2Q14627 380 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 KIR2DS3Q14952 304 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 RPS6KA2Q15349 733 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 DUOXA1Q1HG43 343 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TMEM44Q2T9K0 475 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 EDRF1Q3B7T1 1238 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PHLDA2Q53GA4 152 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ASPRV1Q53RT3 343 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ESCO2Q56NI9 601 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 NHSL2Q5HYW2 709 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ATAT1Q5SQI0 421 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 AGBL2Q5U5Z8 902 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SYDE2Q5VT97 1194 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 RNF220Q5VTB9 566 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FRG2Q64ET8 278 aa-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms