RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 STRA8Q7Z7C7 330 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 GKN2Q86XP6 184 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 CNTN4Q8IWV2 1026 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 MREGQ8N565 214 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 PPM1NQ8N819 430 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 AVL9Q8NBF6 648 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 FAM45AQ8TCE6 357 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 GLMNQ92990 594 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 MTBPQ96DY7 904 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 SLC6A18Q96N87 628 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 UGT1A7Q9HAW7 530 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 UGT1A10Q9HAW8 530 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 UGT1A8Q9HAW9 530 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 SPASTQ9UBP0 616 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 SLC24A2Q9UI40 661 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 R4GN57 208 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 MUC6Q6W4X9 2439 aa9.64□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 UQCRHLA0A096LP55 91 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 A0A0U1RQS6 177 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 PRSS38A1L453 326 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 POM121BA6NF01 834 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 FAM159BA6NKW6 160 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 FADS2P1A8MWK0 482 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 CCL22O00626 93 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 RAD51BO15315 384 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 GRID2O43424 1007 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 DNAJC6O75061 913 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 RPN2P04844 631 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 UQCRHP07919 91 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 FAM153BP0C7A2 387 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 HALP42357 657 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 SLC1A2P43004 574 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 RGS4P49798 205 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 ARSDP51689 593 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 POU4F1Q01851 419 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 DBN1Q16643 649 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 TYSND1Q2T9J0 566 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 FAM153CQ494X1 144 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 TTC23LQ6PF05 361 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 OTOAQ7RTW8 1153 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 RD3Q7Z3Z2 195 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 AMZ2Q86W34 360 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 HID1Q8IV36 788 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 IGDCC3Q8IVU1 814 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 PLA2G15Q8NCC3 412 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 OR13H1Q8NG92 308 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 ASZ1Q8WWH4 475 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM159Q96B96 161 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 COX14Q96I36 57 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 BMFQ96LC9 184 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 FOPNLQ96NB1 174 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 OR2M4Q96R27 311 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 CCM2Q9BSQ5 444 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 FUT8Q9BYC5 575 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 OR2AG1Q9H205 316 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 FAM96AQ9H5X1 160 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 SYTL2Q9HCH5 934 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 CYP4F12Q9HCS2 524 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF180Q9UJW8 692 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 TLK1Q9UKI8 766 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 DGKBQ9Y6T7 804 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa9.63□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 OR51F1A6NGY5 319 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 PROB1E7EW31 1015 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 GOLGA8TH3BQL2 631 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 K7ESM1 405 aa9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 RASGRF2O14827 1237 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.9 ms