RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 PRSS2P07478 247 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 SRCP12931 536 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 PRLRP16471 622 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 IL11P20809 199 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 NMBRP28336 390 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 KRT20P35900 424 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 PPP5CP53041 499 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 PNLIPRP2P54317 469 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 RAD23BP54727 409 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 CD81P60033 236 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 TUBA1BP68363 451 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 DSC1Q08554 894 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 LRMPQ12912 555 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 UBE2V1Q13404 147 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 KCNC3Q14003 757 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 RAB6CQ53S08 254 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 IGSF11Q5DX21 431 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 EFHC1Q5JVL4 640 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 CFAP58Q5T655 872 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 PRSS57Q6UWY2 283 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 ADIPOR2Q86V24 386 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 GALNT13Q8IUC8 556 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 IQCF1Q8N6M8 205 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 GSDMBQ8TAX9 411 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 ERP27Q96DN0 273 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 FEM1CQ96JP0 617 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 CEP295NLQ96MC4 621 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 NCAPGQ9BPX3 1015 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 SLF1Q9BQI6 1058 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 HGH1Q9BTY7 390 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 RAB6CQ9H0N0 254 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 ZNF224Q9NZL3 707 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 WNT16Q9UBV4 365 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 SIX4Q9UIU6 781 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 FBXL2Q9UKC9 423 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 NFS1Q9Y697 457 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 KIF26BQ2KJY2 2108 aa3.19□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 A0A0G2JPF8 293 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 TMEM178BH3BS89 294 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 J3QR06 171 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 PLK4O00444 970 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 DAB1O75553 588 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 DNTTP04053 509 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 HIST1H2ABP04908 130 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 NR2F1P10589 423 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 HIST1H2ADP20671 130 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 NNMTP40261 264 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 KRTAP10-3P60369 221 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 TFAP4Q01664 338 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 NUCB1Q02818 461 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 EGR4Q05215 589 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 CXCL9Q07325 125 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 ZBTB17Q13105 803 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 GRAPQ13588 217 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 HLFQ16534 295 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 CALCRLQ16602 461 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 SYT16Q17RD7 645 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 C9orf57Q5W0N0 161 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 TEX38Q6PEX7 206 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 Q75L30 129 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 SLC38A9Q8NBW4 561 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 LMO3Q8TAP4 145 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 SPATA20Q8TB22 786 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 TMEM19Q96HH6 336 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 ADGRG7Q96K78 797 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 GCNAQ96QF7 691 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 OR1F2PQ96R84 312 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 MAGIXQ9H6Y5 334 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 MCM9Q9NXL9 1143 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 TAS2R14Q9NYV8 317 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 DNAJB4Q9UDY4 337 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 FAM169AQ9Y6X4 670 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 WDR81Q562E7 1941 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 PTPRCP08575 1304 aa3.18□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 FEZF1A0PJY2 475 aa3.17□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 LINC01565O15544 149 aa3.17□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 KCNN4O15554 427 aa3.17□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 GPC4O75487 556 aa3.17□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 PSMD10O75832 226 aa3.17□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 GAGE7O76087 117 aa3.17□□□□□ -1.9
SENP6-208ENST00000483859 GCNT3O95395 438 aa3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms