RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CSADQ9Y600 493 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MYBPHLA2RUH7 354 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PRSS56P0CW18 603 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MTHFD2P13995 350 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CCNA1P78396 465 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ARHGAP1Q07960 439 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNAB2Q13303 367 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NKG7Q16617 165 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 COQ5Q5HYK3 327 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SPESP1Q6UW49 350 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC81Q6ZN84 652 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CYP2U1Q7Z449 544 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 LGI2Q8N0V4 545 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SCML4Q8N228 414 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MFSD4AQ8N468 514 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ITFG1Q8TB96 612 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 FIG4Q92562 907 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF560Q96MR9 790 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TRPV5Q9NQA5 729 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SNX5Q9Y5X3 404 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 U3KQV3 271 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TSC2P49815 1807 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 G3V2T6 193 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 M0R3G1 203 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NDUFS2O75306 463 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC22A3O75751 556 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PARNO95453 639 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 S1PR4O95977 384 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CDH1P12830 882 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NR4A2P43354 598 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 AGTR2P50052 363 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TTLL4Q14679 1199 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CATSPEREQ5SY80 951 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF549Q6P9A3 640 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA0408Q6ZU52 694 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2T11Q8NH01 316 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PSMA8Q8TAA3 256 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 S100ZQ8WXG8 99 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 KCTD13Q8WZ19 329 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TSGA13Q96PP4 275 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 KLHL5Q96PQ7 755 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 RHNO1Q9BSD3 238 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 IKZF3Q9UKT9 509 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 DERAQ9Y315 318 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ENPP3O14638 875 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TBC1D4O60343 1298 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 GJB3O75712 270 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CCNCP24863 283 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CD86P42081 329 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 DGKQP52824 942 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NCS1P62166 190 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 GRIK4Q16099 956 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 MARCH8Q5T0T0 291 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 UGT3A1Q6NUS8 523 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TXNDC11Q6PKC3 985 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ADCK1Q86TW2 530 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CLIP4Q8N3C7 705 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM199Q8N511 208 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 FRS2Q8WU20 508 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NODALQ96S42 347 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NT5MQ9NPB1 228 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PRDM8Q9NQV8 689 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 AIG1Q9NVV5 245 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 GDAP2Q9NXN4 497 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 NEU3Q9UQ49 428 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 C16orf96A6NNT2 1141 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC1A7O00341 560 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 HS6ST1O60243 411 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 DDNO94850 711 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PIRTP0C851 137 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 IHHQ14623 411 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 ALKAL1Q6UXT8 129 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TRIB2Q92519 343 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 OTUD5Q96G74 571 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 PCED1BQ96HM7 432 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 TBATAQ96M53 351 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 CYP2S1Q96SQ9 504 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 SMOC2Q9H3U7 446 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-206ENST00000469947 RMND5AQ9H871 391 aa13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms