RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461648.2

TSC2-208, Transcript of TSC complex subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene TSC2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2-208ENST00000461648 CCDC25Q86WR0 208 aa25.19■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 OTUD6BQ8N6M0 293 aa25.19■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa25.19■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 LMX1AQ8TE12 382 aa25.19■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 OR2M4Q96R27 311 aa25.19■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 TTC1Q99614 292 aa25.19■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa25.19■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 GPSM3Q9Y4H4 160 aa25.19■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 CFAP99D6REC4 459 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 GOLGA8KD6RF30 607 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 GOLGA8TH3BQL2 631 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 CHUKO15111 745 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 GRID2O43424 1007 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 LIMK1P53667 647 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 B4GALNT1Q00973 533 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 SLC14A1Q13336 389 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 C1orf61Q13536 156 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 ITIH4Q14624 930 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 STEAP4Q687X5 459 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 GATAD2AQ86YP4 633 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 PYROXD1Q8WU10 500 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 TMEM168Q9H0V1 697 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 PLAC1Q9HBJ0 212 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 UCKL1Q9NWZ5 548 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 PRKAB1Q9Y478 270 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 AQP9O43315 295 aa25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 ECHS1P30084 290 aa25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 TUBB4BP68371 445 aa25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 ELOCQ15369 112 aa25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 MRNIPQ6NTE8 343 aa25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 NEPROQ6NW34 567 aa25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 CRTC3Q6UUV7 619 aa25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 LRRTM4Q86VH4 590 aa25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 PNPLA1Q8N8W4 532 aa25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 GPR150Q8NGU9 434 aa25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 BOCQ9BWV1 1114 aa25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa25.17■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 TTPAP49638 278 aa25.16■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 CTSCP53634 463 aa25.16■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 ARHGAP8P85298 464 aa25.16■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 TCEA2Q15560 299 aa25.16■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 TMEM220Q6QAJ8 160 aa25.16■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 CEP128Q6ZU80 1094 aa25.16■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 DET1Q7L5Y6 550 aa25.16■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa25.16■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 SLC25A45Q8N413 288 aa25.16■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 FMO2Q99518 471 aa25.16■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 CLPBQ9H078 707 aa25.16■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 KMOO15229 486 aa25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 OGNP20774 298 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 PMLP29590 882 aa25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 NSG1P42857 185 aa25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 MAGEA4P43358 317 aa25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 PACS1Q6VY07 963 aa25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 KCNMB4Q86W47 210 aa25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 ZNF547Q8IVP9 402 aa25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 PALM2Q8IXS6 379 aa25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 LMNTD2Q8IXW0 634 aa25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 UNC5BQ8IZJ1 945 aa25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 NETO1Q8TDF5 533 aa25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 SGF29Q96ES7 293 aa25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 TSPYL1Q9H0U9 437 aa25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 GPR34Q9UPC5 381 aa25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa25.15■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 NEMP2A6NFY4 417 aa25.14■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 OR2AG2A6NM03 316 aa25.14■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 CD59P13987 128 aa25.14■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 CTBSQ01459 385 aa25.14■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 LRP8Q14114 963 aa25.14■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 TYSND1Q2T9J0 566 aa25.14■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 BCL7AQ4VC05 210 aa25.14■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa25.14■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 ZNF470Q6ECI4 717 aa25.14■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 DBX2Q6ZNG2 339 aa25.14■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 GKN2Q86XP6 184 aa25.14■■□□□ 1.62
TSC2-208ENST00000461648 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms