RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430930.5

TNS1-207, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-207ENST00000430930 KCTD21Q4G0X4 260 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 PJA1Q8NG27 643 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 SPOCK2Q92563 424 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 ING3Q9NXR8 418 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 ZNF222Q9UK12 451 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 VIPP01282 170 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 CCT3P49368 545 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 GSTCDQ8NEC7 633 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 APOLD1Q96LR9 279 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 CHID1Q9BWS9 393 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 PTPRJQ12913 1337 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 FADS2P1A8MWK0 482 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 KCNU1A8MYU2 1149 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 BCKDKO14874 412 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 SDC2P34741 201 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.337e-7■■■■□ 25.4
TNS1-207ENST00000430930 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 SLC43A3Q8NBI5 491 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 IPPKQ9H8X2 491 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 ARHGEF4Q9NR80 690 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 PACSIN3Q9UKS6 424 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 TMEM88BA6NKF7 163 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 SIN3BO75182 1162 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 ZNF697Q5TEC3 545 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 CEP68Q76N32 757 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 KBTBD2Q8IY47 623 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 UNC5BQ8IZJ1 945 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 FAM83DQ9H4H8 585 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 FADS3Q9Y5Q0 445 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 RGS10O43665 173 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 PRAMEF1O95521 474 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 ESR1P03372 595 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 SMCO1Q147U7 214 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 FAM124AQ86V42 546 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 PARGQ86W56 976 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 LRRC57Q8N9N7 239 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 UNC93B1Q9H1C4 597 aa13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 FAM92AA1XBS5 289 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 TAF4O00268 1085 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 UGT2B4P06133 528 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 GIMD1P0DJR0 217 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 CCNFP41002 786 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 PTGER3P43115 390 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 C2orf80Q0P641 193 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 IRF2BP1Q8IU81 584 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 ZNF567Q8N184 647 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 MPP5Q8N3R9 675 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 OR6K2Q8NGY2 324 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 RIT1Q92963 219 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 FEM1CQ96JP0 617 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 CLPTM1LQ96KA5 538 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 DEFB118Q96PH6 123 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 CHRAC1Q9NRG0 131 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 IGSF9Q9P2J2 1179 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 FBXW11Q9UKB1 542 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 CASKO14936 926 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 ADAMDEC1O15204 470 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 IDH3BO43837 385 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 KERAO60938 352 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 TIPRLO75663 272 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 CYP4B1P13584 511 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 RPIAP49247 311 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 DLG1Q12959 904 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 RAPSNQ13702 412 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 LDLRAP1Q5SW96 308 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 FUT10Q6P4F1 479 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 SPPL2CQ8IUH8 684 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 AZIN2Q96A70 460 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 TNFRSF11BO00300 401 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 XKRYO14609 159 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 CDK14O94921 469 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 IFNW1P05000 195 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 PCCBP05166 539 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 DSC2Q02487 901 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 GBE1Q04446 702 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 KCNA10Q16322 511 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 SLC34A3Q8N130 599 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 AHI1Q8N157 1196 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 TSSK3Q96PN8 268 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 SLIT2O94813 1529 aa12.99□□□□□ -0.33
TNS1-207ENST00000430930 CLCNKBP51801 687 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms