RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 VSTM4Q8IW00 320 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 OR2T34Q8NGX1 318 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 OMDQ99983 421 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 KNL1Q8NG31 2342 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.33□□□□□ -1.4
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PTPRK-211ENST00000429595 RARGP13631 454 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 GPD1P21695 349 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PRKCHP24723 683 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 UGT1A5P35504 534 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 GRIA3P42263 894 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 NPTX2P47972 431 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CCR5P51681 352 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SLC5A3P53794 718 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 UBASH3AP57075 661 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 LRMPQ12912 555 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ENPP2Q13822 863 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 POSTNQ15063 836 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CDKN3Q16667 212 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 JADE1Q6IE81 842 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 IQCHQ86VS3 1027 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ZFAND4Q86XD8 727 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ERMNQ8TAM6 284 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 FBXL20Q96IG2 436 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 C5orf34Q96MH7 638 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF560Q96MR9 790 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 INTS13Q9NVM9 706 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PLK2Q9NYY3 685 aa6.33□□□□□ -1.4
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PTPRK-211ENST00000429595 IFNKQ9P0W0 207 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PISDQ9UG56 409 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SUN2Q9UH99 717 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SCML1Q9UN30 329 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 DNM3Q9UQ16 869 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 MYOFQ9NZM1 2061 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CITO14578 2027 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CENPEQ02224 2701 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 WDR91A4D1P6 747 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D3LB9A6J9 549 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 COCHO43405 550 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PRAMEF10O60809 474 aa6.32□□□□□ -1.4
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PTPRK-211ENST00000429595 TUBBP07437 444 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D3HP0C7X1 549 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PRF1P14222 555 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 BDNFP23560 247 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 YWHAQP27348 245 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CD82P27701 267 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 KRT2P35908 639 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R2P41236 205 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PNPLA4P41247 253 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 LHX1P48742 406 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 MFAP3P55082 362 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TMPRSS15P98073 1019 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 MCL1Q07820 350 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 FGL2Q14314 439 aa6.32□□□□□ -1.4
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