RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ESR1P03372 595 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 COX4I1P13073 169 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ARSAP15289 507 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 EZRP15311 586 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ITGALP20701 1170 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CCND1P24385 295 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 HK2P52789 917 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP6V0D1P61421 351 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 BTKQ06187 659 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 GPM6BQ13491 265 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CUL3Q13618 768 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 NAA25Q14CX7 972 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CHRNA6Q15825 494 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF77Q15935 545 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAL1Q4LDG9 190 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 C9orf50Q5SZB4 431 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM68Q6AZZ1 485 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CRTC1Q6UUV9 634 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RFLNAQ6ZTI6 216 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 SCUBE1Q8IWY4 988 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 STK40Q8N2I9 435 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXO39Q8N4B4 442 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CEP70Q8NHQ1 597 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 GIMAP7Q8NHV1 300 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RHEBL1Q8TAI7 183 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CD200R1Q8TD46 325 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 TRPC4APQ8TEL6 797 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR60Q8WVS4 1066 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNJ9Q92806 393 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 LINGO1Q96FE5 620 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC1Q99614 292 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CIPCQ9C0C6 399 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CLPBQ9H078 707 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 MTG2Q9H4K7 406 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CRLS1Q9UJA2 301 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 APPL1Q9UKG1 709 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 COMMD10Q9Y6G5 202 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD36A6QL64 1941 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC189A1A4V9 331 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 VGLL3A8MV65 326 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF197O14709 1029 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 AIM2O14862 343 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 KERAO60938 352 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PEX11AO75192 247 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RB1P06400 928 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PIK3R1P27986 724 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 HOXA9P31269 272 aa3.94□□□□□ -1.78
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LRRTM4-201ENST00000409088 VIPR2P41587 438 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 AGTR2P50052 363 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 EPHA4P54764 986 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 NFATC2Q13469 925 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CDKN3Q16667 212 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PRSS36Q5K4E3 855 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 WASHC2DQ5SRD0 308 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC66Q68CR7 880 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM215Q68D42 235 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 UGT3A1Q6NUS8 523 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CERS6Q6ZMG9 384 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 TPRG1Q6ZUI0 275 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 USP45Q70EL2 814 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 RTL10Q7L3V2 364 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 SNX20Q7Z614 316 aa3.94□□□□□ -1.78
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LRRTM4-201ENST00000409088 ADIPOR2Q86V24 386 aa3.94□□□□□ -1.78
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LRRTM4-201ENST00000409088 GPR26Q8NDV2 337 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
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LRRTM4-201ENST00000409088 SCRN2Q96FV2 425 aa3.94□□□□□ -1.78
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LRRTM4-201ENST00000409088 KLHL32Q96NJ5 620 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC3BQ96PB8 259 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 TRMOQ9BU70 441 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC28BQ9BUN5 200 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 APOL5Q9BWW9 433 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 BRD9Q9H8M2 597 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 MID1IP1Q9NPA3 183 aa3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa3.94□□□□□ -1.78
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