RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391266.1

RNU6-1254P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1254, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1254P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A0A087WWV3 80 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SHISA9B4DS77 424 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TEX22C9J3V5 150 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HDAC3O15379 428 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SPINT2O43291 252 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LATO43561 262 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NBNO60934 754 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ACTL6BO94805 426 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CSPG5O95196 566 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MLYCDO95822 493 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TNFSF4P23510 183 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MMP12P39900 470 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OPRL1P41146 370 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GSDMDP57764 484 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 AP2B1P63010 937 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FOXM1Q08050 763 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CD300CQ08708 224 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DECR1Q16698 335 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DUOXA1Q1HG43 343 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 EDRF1Q3B7T1 1238 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MOGAT2Q3SYC2 334 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SYCP2LQ5T4T6 812 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 WLSQ5T9L3 541 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GPR157Q5UAW9 335 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GGNBP1Q5YKI7 109 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C17orf99Q6UX52 265 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PACS1Q6VY07 963 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RINLQ6ZS11 566 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 Q75L30 129 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RRAGAQ7L523 313 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SYT13Q7L8C5 426 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C11orf96Q7Z7L8 435 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TSPAN33Q86UF1 283 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GPR180Q86V85 440 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC25A42Q86VD7 318 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CPXM2Q8N436 756 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LINS1Q8NG48 757 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RDM1Q8NG50 284 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM71BQ8TC56 605 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SPPL3Q8TCT6 385 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LRRC15Q8TF66 581 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 STAG1Q8WVM7 1258 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HPSE2Q8WWQ2 592 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MUL1Q969V5 352 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C3orf49Q96BT1 292 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 EID2BQ96D98 161 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NUS1Q96E22 293 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SIN3AQ96ST3 1273 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MYD88Q99836 296 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FUCA2Q9BTY2 467 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NUF2Q9BZD4 464 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LMAN2LQ9H0V9 348 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC32A1Q9H598 525 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CHST12Q9NRB3 414 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ECHDC1Q9NTX5 307 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DACT1Q9NYF0 836 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 COQ3Q9NZJ6 369 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TSPAN16Q9UKR8 245 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF510Q9Y2H8 683 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NACAE9PAV3 2078 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MUC6Q6W4X9 2439 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ITGB4P16144 1822 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A0A1W2PQ72 361 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ASB14A6NK59 587 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM90A26D6RGX4 464 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ANKRD28O15084 1053 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LRCH4O75427 683 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SCGB1D2O95969 90 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LIPFP07098 398 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KRT19P08727 400 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF17P17021 662 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ETV5P41161 510 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CTSCP53634 463 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMEM50BP56557 158 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PTK2BQ14289 1009 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SPARCL1Q14515 664 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IZUMO3Q5VZ72 239 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF841Q6ZN19 808 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM160B2Q86V87 743 aa0.31□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms