RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 PIGUQ9H490 435 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SAGE2PA6NJ88 616 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ERN1O75460 977 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PRPS2P11908 318 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT5Q7Z7M9 940 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 AKAP14Q86UN6 197 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SVOPLQ8N434 492 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS15Q8TE58 950 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SH3GLB1Q9Y371 365 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 H3BNH8 94 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CDK14O94921 469 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PTPN5P54829 565 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 RPTNQ6XPR3 784 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TAC4Q86UU9 113 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SLCO2A1Q92959 643 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 FZD10Q9ULW2 581 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GVM2 712 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 DPPA5A6NC42 116 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF11BO00300 401 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CHST10O43529 356 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PEX2P28328 305 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 LILRA4P59901 499 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PLET1Q6UQ28 207 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 FAM131AQ6UXB0 335 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CLIP3Q96DZ5 547 aa20.97■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 FADS2P1A8MWK0 482 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 OR5F1O95221 314 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 DHFRP00374 187 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ESR1P03372 595 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 DAOAP59103 153 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 COL20A1Q9P218 1284 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 POMPQ9Y244 141 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMDEC1O15204 470 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TCF4P15884 667 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 BCAP31P51572 246 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 AP1S1P61966 158 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 IL10RBQ08334 325 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PEX6Q13608 980 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ZZZ3Q8IYH5 903 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 IFNW1P05000 195 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 UGT2B4P06133 528 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 GTF2H2Q13888 395 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 NPY5RQ15761 445 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 SULT1C3Q6IMI6 304 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 FAR1Q8WVX9 515 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ACSS2Q9NR19 701 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 MRC1P22897 1456 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 MPZL2O60487 215 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF1O95521 474 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 HSPA7P48741 367 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PNLIPRP1P54315 467 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 UNC5BQ8IZJ1 945 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 RAD51AP1Q96B01 352 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PDCD10Q9BUL8 212 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 DTLQ9NZJ0 730 aa20.96■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PLOD3O60568 738 aa20.95■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 OR4Q2P0C623 313 aa20.95■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.95■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PCED1BQ96HM7 432 aa20.95■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.95■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 PADI3Q9ULW8 664 aa20.95■□□□□ 0.95
CCSAP-201ENST00000284617 GLUD1P00367 558 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 LAPTM5Q13571 262 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM39Q9HCM9 518 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 FAM149AA5PLN7 773 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 INSIG1O15503 277 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 GDF10P55107 478 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 PHF11Q9UIL8 331 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 AREL1O15033 823 aa20.95■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 NAE1Q13564 534 aa20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms