RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 MARCH9Q86YJ5 346 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 KLHL7Q8IXQ5 586 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 NXPE1Q8N323 547 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 MCUQ8NE86 351 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 GLMNQ92990 594 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D29Q9UFV1 150 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CCDC162PA2VCL2 907 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 KMOO15229 486 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 GAS8O95995 478 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CDK4P11802 303 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 ITGALP20701 1170 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 MGAT1P26572 445 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 FOXN2P32314 431 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 RPIAP49247 311 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 GPR33Q49SQ1 333 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 C14orf28Q4W4Y0 310 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 XKR5Q6UX68 686 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 HDAC10Q969S8 669 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 IL22Q9GZX6 179 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 KLC4Q9NSK0 619 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 TREX1Q9NSU2 369 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 BFARQ9NZS9 450 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CEP295Q9C0D2 2601 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CCDC188H7C350 402 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 OPA1O60313 960 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 PAFAH1B1P43034 410 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 MAZP56270 477 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 LAMB3Q13751 1172 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CDCP2Q5VXM1 449 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 TMEM220Q6QAJ8 160 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 MPP5Q8N3R9 675 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 ARL14Q8N4G2 192 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 PEX13Q92968 403 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 ULK4Q96C45 1275 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 SGF29Q96ES7 293 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 TIMM29Q9BSF4 260 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 KIFC1Q9BW19 673 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 SYBUQ9NX95 663 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 CRLS1Q9UJA2 301 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 RNF215Q9Y6U7 377 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-201ENST00000236273 ASPMQ8IZT6 3477 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 AP3B1O00203 1094 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 ACRV1P26436 265 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 NMBRP28336 390 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 MAGEA3P43357 314 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 E2F1Q01094 437 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 CACNG1Q06432 222 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R7Q15435 360 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 IYDQ6PHW0 289 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 NLRP9Q7RTR0 991 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 SERPINA9Q86WD7 417 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 NAT6Q93015 286 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 CCDC74AQ96AQ1 378 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 SGSM3Q96HU1 749 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 SERPINB12Q96P63 405 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 PRDM8Q9NQV8 689 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 OR2AG2A6NM03 316 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 POP7O75817 140 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 GOT2P00505 430 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 MLNP12872 115 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 GLB1P16278 677 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 MSH3P20585 1137 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 DBN1Q16643 649 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 TMPRSS12Q86WS5 348 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 JAMLQ86YT9 394 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 SFRP1Q8N474 314 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 SPATA4Q8NEY3 305 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 TTC25Q96NG3 672 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 CCDC3Q9BQI4 270 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 EVA1BQ9NVM1 165 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 FRYQ5TBA9 3013 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 FAM149AA5PLN7 773 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA8MH3BSY2 632 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 PPM1DO15297 605 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 ARNTP27540 789 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 DR1Q01658 176 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 GTF2H3Q13889 308 aa21.93■■□□□ 1.1
SYF2-201ENST00000236273 SEMA3AQ14563 771 aa21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms