RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034432.6

Cfdp1-201, Transcript of Craniofacial development protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cfdp1, Length 1,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Ppp2r2cQ8BG02 447 aa14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Vipas39Q8BGQ1 491 aa14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Tyw1Q8BJM7 721 aa14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Dus1lQ8C2P3 475 aa14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 TxlnbQ8VBT1 685 aa14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Cdc42ep1Q91W92 409 aa14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Ak5Q920P5 562 aa14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Pcyt2Q922E4 404 aa14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Hhipl2Q9D2G9 717 aa14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Arl13aQ9D416 372 aa14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Dennd6bQ9D9V7 585 aa14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Gm29797A0A140LIA7 188 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Itga9B8JK39 1036 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Ifnar2O35664 513 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Mucl2P02815 138 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Ap2a1P17426 977 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Sec24aQ3U2P1 1090 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 MarcoQ60754 518 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 E2f1Q61501 430 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 E2f5Q61502 335 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Arl13bQ640N2 427 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Ip6k1Q6PD10 433 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Olfr1344Q7TQV3 321 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Vrk1Q80X41 440 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Snip1Q8BIZ6 383 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Yipf4Q8C407 246 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Actl9Q8CG27 415 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1700001C19RikQ8K168 210 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Map3k21Q8VDG6 1002 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Chst15Q91XQ5 561 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Bag2Q91YN9 210 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Dhrs1Q99L04 313 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Q9CWU4 180 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Eif3iQ9QZD9 325 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Coro1cQ9WUM4 474 aa14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Zfp352A2AML7 551 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Syndig1A2ANU3 258 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Gm4969D3YZT1 566 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Zfp963D3Z2T8 383 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Speer2E9Q9U2 264 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 NelfeP19426 375 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Akt1P31750 480 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Slc10a2P70172 348 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 NeblQ0II04 452 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Nat9Q3UG98 241 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 StradaQ3UUJ4 431 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Cyb5d1Q5NCY3 228 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Mfsd3Q5U419 412 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 HadhQ61425 314 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Ccnt2Q7TQK0 723 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Got1l1Q7TSV6 404 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Lrrtm4Q80XG9 590 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 C1qtnf7Q8BVD7 289 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Shisa7Q8C3Q5 558 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Lrp11Q8CB67 483 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Phc3Q8CHP6 981 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Ugt2b34Q8K154 532 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Ccdc137Q8R0K4 290 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Vmn1r87Q8R255 295 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Cops8Q8VBV7 209 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Satb2Q8VI24 733 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Mrps17Q9CQE3 120 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Znf524Q9D0B1 321 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Stx17Q9D0I4 301 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Prpsap1Q9D0M1 356 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Clca1Q9D7Z6 913 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Reg4Q9D8G5 157 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Phf2Q9WTU0 1096 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 RgrQ9Z2B3 291 aa14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Hectd1Q69ZR2 2618 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Tcrg-V3A0A0G2JEW2 117 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Slfn3A0A1L1STQ7 640 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Gm12248A0A1W2P8B8 313 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Tgm7A2ART8 616 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Ttll11A4Q9F4 727 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Ldb2O55203 373 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Gabrg3P27681 467 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Fgf11P70378 225 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Pde7aP70453 456 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Rtel1Q0VGM9 1203 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 ZufspQ3T9Z9 577 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Sp140Q6NSQ5 534 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Zmiz1Q6P1E1 1072 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Avl9Q80U56 649 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Prox2Q8BII1 593 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Efemp1Q8BPB5 493 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Zfp263Q8CF60 680 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Klk13Q8CGR6 276 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Arel1Q8CHG5 823 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Esrp2Q8K0G8 717 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Ppp4r1Q8K2V1 951 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 VitQ8VHI5 650 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Adcy4Q91WF3 1077 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Dusp3Q9D7X3 185 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Wdr83Q9DAJ4 315 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 RangrfQ9JIB0 185 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Acot2Q9QYR9 453 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Eif2s3xQ9Z0N1 472 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Cpne6Q9Z140 557 aa14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1-201ENSMUST00000034432 Vwa5b1A9Z1V5 1215 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.8 ms