RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr664Q7TRP5 306 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4930503B20RikQ80ZP0 234 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clp1Q99LI9 425 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgap8Q9CXP4 425 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab13Q9DD03 202 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ank1Q02357 1862 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atrnl1Q6A051 1378 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adam19O35674 920 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PrkcqQ02111 707 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim67Q505D9 768 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nr1h4Q60641 488 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klra8Q60682 266 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnajc15Q78YY6 149 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BlmhQ8R016 455 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mfsd5Q921Y4 450 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Traf7Q922B6 594 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Glod4Q9CPV4 298 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Katnal2Q9D3R6 539 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp3a41aQ9JMA7 504 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myo7aP97479 2215 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adamts14E9PX39 1209 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Herc6F2Z461 1003 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cldn2O88552 230 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Anxa6P14824 673 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gdi1P50396 447 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 E2f2P56931 443 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ezh1P70351 747 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm8773Q3UQ24 132 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rad54bQ6PFE3 886 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1418Q7TQS3 318 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr735Q7TRM4 354 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr667Q7TRP4 326 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MmaaQ8C7H1 415 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acap1Q8K2H4 740 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr273Q8VG87 317 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tada1Q99LM9 335 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9CQF4 240 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tdrd12Q9CWU0 1215 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Actrt2Q9D9L5 377 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc28a3Q9ERH8 703 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gtf2h2Q9JIB4 396 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psmd13Q9WVJ2 376 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sema4fQ9Z123 777 aa12.72□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cldn34b1B1AZQ8 209 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r84D3YWE3 849 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r44L7N2E1 861 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnk2O54967 1055 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hoxa2P31245 372 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Agtr2P35374 363 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prox1P48437 737 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BC030870Q3V2G4 71 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prss36Q5K2P8 849 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Map3k3Q61084 626 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vat1Q62465 406 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1505Q7TQQ2 316 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 D3Ertd751eQ8BGN2 192 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smndc1Q8BGT7 238 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc32Q8BS39 179 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 UstQ8BUB6 407 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spp2Q8K1I3 203 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1176Q8VG40 315 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sfxn1Q99JR1 322 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mcm8Q9CWV1 833 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ssu72Q9CY97 194 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DlstQ9D2G2 454 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf138rt1Q9D9M9 248 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cldn34b2Q9D9N2 209 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HemgnQ9ERZ0 503 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ap3m1Q9JKC8 418 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Extl1Q9JKV7 669 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lama4P97927 1816 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mroh5E9PUJ8 762 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfm1O88998 485 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CcnhQ61458 323 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ifi47Q61635 420 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Brsk2Q69Z98 735 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GsdmcQ99NB5 468 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trem2Q99NH8 227 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TsaccQ9DA44 124 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp831A2ADM8 1628 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ets2P15037 468 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gja1P23242 382 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpl3P27659 403 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rps7P62082 194 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sh3gl3Q62421 347 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 S100a15aQ6S5I3 108 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myl12aQ6ZWQ9 172 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tprg1Q8CB49 279 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gramd1aQ8VEF1 722 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdhga6Q91XY2 932 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Itfg1Q99KW9 610 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ints11Q9CWS4 600 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Armc1Q9D7A8 282 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcea2Q9QVN7 299 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Itgb1bp2Q9R000 350 aa12.71□□□□□ -0.37
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Casz1Q9CWL2 1761 aa12.71□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abca3Q8R420 1704 aa12.71□□□□□ -0.38
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ring1O35730 406 aa12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.8 ms