RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023452.13

Ccdc116-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 116, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc116, Length 4,210 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Dok6Q2MHE5 331 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Q3U7U4 132 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Zfp658Q5PPQ4 887 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Myo1dQ5SYD0 1006 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Slc6a3Q61327 619 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Vwa2Q70UZ7 791 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Olfr1128Q7TR47 311 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Cyth4Q80YW0 393 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Osbpl6Q8BXR9 959 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Usp3Q91W36 520 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Cyp4f3Q99N16 524 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 1700080O16RikQ9D9G4 284 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Slc25a13Q9QXX4 676 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Map2k5Q9WVS7 448 aa9□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Plce1Q8K4S1 2282 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Gm3752A6NAT4 150 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Olfr292F8VQ84 308 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Vmn2r112L7N221 857 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Vmn2r61L7N2B8 865 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Hk2O08528 917 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 NapsaO09043 419 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 BgnP28653 369 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Ppm1aP49443 382 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Impdh1P50096 514 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Ndst2P52850 883 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Hrh1P70174 488 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Tmem207P86045 143 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Hdgfl2Q3UMU9 669 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Q3UY34 256 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Rundc3bQ6PDC0 408 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Olfr293Q7TS10 336 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 1700001J03RikQ80ZR8 219 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Sec24bQ80ZX0 1251 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Zfyve1Q810J8 777 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Mterf1aQ8CHZ9 379 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Vmn1r18Q8R2C8 299 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Hspa12bQ9CZJ2 685 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Slc5a3Q9JKZ2 718 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 CasrQ9QY96 1079 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Vmn2r17E9PYF5 849 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Zfp384E9Q1A5 584 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Gm8879F6R3J9 157 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Gm6337K7N6X9 211 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Gm3115L7N285 211 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Gm8897L7N294 181 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Dnmt3cP0DOY1 709 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Anxa6P14824 673 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Ephx2P34914 554 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Acsl1P41216 699 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 ArvcfP98203 962 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Spata48Q5NC83 441 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 PkdccQ5RJI4 492 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 GkQ64516 559 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Trit1Q80UN9 467 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Cdkn3Q810P3 211 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Slc6a15Q8BG16 729 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Kctd13Q8BGV7 329 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 StgQ8BM15 349 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Serpinb9dQ8BMT0 377 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Parp9Q8CAS9 866 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 BtdQ8CIF4 520 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Gsg1Q8R1W2 324 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Ttc4Q8R3H9 386 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Epm2aip1Q8VEH5 606 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Vps4aQ8VEJ9 437 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Epb41l1Q9Z2H5 879 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 DnpepQ9Z2W0 473 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Cyp4a29A0A087WPC3 509 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Ttll8A4Q9F1 832 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Olfr652B9EHE6 318 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Pdzd8B9EJ80 1147 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Gm20828J3KMI7 228 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Polr2jO08740 117 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 GfapP03995 430 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Smad5P97454 465 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 HexdcQ3U4H6 486 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Prss53Q571E5 552 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Pde1aQ61481 565 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Arhgap30Q640N3 1101 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Rexo4Q6PAQ4 432 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Klhl5Q6PFE1 708 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Olfr1085Q7TR64 313 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Msantd1Q8BIL2 278 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Scamp1Q8K021 338 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 ClmpQ8R373 373 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Olfr1325Q8VF43 315 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Olfr371Q8VGB8 312 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Abtb1Q99LJ2 478 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 St7Q99M96 577 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Mrpl9Q99N94 265 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 TcimQ9D915 106 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 IcmtQ9EQK7 283 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Gria3Q9Z2W9 888 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 SisF8VQM5 1818 aa8.99□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Rpl9-ps6A0A140T8T4 192 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 SmoktcrA2KF29 484 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 MntO08789 591 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 Cdh1P09803 884 aa8.98□□□□□ -0.97
Ccdc116-201ENSMUST00000023452 LynP25911 512 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.9 ms