Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZX0

Sec24b, Sec24-related gene family, member B (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24bQ80ZX0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Sec24bQ80ZX0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Sec24bQ80ZX0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sec24bQ80ZX0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Sec24bQ80ZX0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sec24bQ80ZX0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Sec24bQ80ZX0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sec24bQ80ZX0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sec24bQ80ZX0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sec24bQ80ZX0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sec24bQ80ZX0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sec24bQ80ZX0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sec24bQ80ZX0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sec24bQ80ZX0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sec24bQ80ZX0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sec24bQ80ZX0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sec24bQ80ZX0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sec24bQ80ZX0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sec24bQ80ZX0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sec24bQ80ZX0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sec24bQ80ZX0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sec24bQ80ZX0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sec24bQ80ZX0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sec24bQ80ZX0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sec24bQ80ZX0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sec24bQ80ZX0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sec24bQ80ZX0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sec24bQ80ZX0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sec24bQ80ZX0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sec24bQ80ZX0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sec24bQ80ZX0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sec24bQ80ZX0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sec24bQ80ZX0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sec24bQ80ZX0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sec24bQ80ZX0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sec24bQ80ZX0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sec24bQ80ZX0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sec24bQ80ZX0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sec24bQ80ZX0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Sec24bQ80ZX0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sec24bQ80ZX0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sec24bQ80ZX0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sec24bQ80ZX0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sec24bQ80ZX0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sec24bQ80ZX0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sec24bQ80ZX0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sec24bQ80ZX0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sec24bQ80ZX0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sec24bQ80ZX0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sec24bQ80ZX0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sec24bQ80ZX0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sec24bQ80ZX0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sec24bQ80ZX0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sec24bQ80ZX0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sec24bQ80ZX0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sec24bQ80ZX0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sec24bQ80ZX0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sec24bQ80ZX0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sec24bQ80ZX0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sec24bQ80ZX0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sec24bQ80ZX0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sec24bQ80ZX0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sec24bQ80ZX0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sec24bQ80ZX0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sec24bQ80ZX0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sec24bQ80ZX0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sec24bQ80ZX0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sec24bQ80ZX0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Sec24bQ80ZX0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sec24bQ80ZX0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sec24bQ80ZX0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sec24bQ80ZX0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sec24bQ80ZX0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sec24bQ80ZX0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sec24bQ80ZX0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sec24bQ80ZX0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sec24bQ80ZX0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sec24bQ80ZX0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sec24bQ80ZX0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sec24bQ80ZX0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sec24bQ80ZX0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sec24bQ80ZX0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sec24bQ80ZX0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sec24bQ80ZX0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sec24bQ80ZX0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sec24bQ80ZX0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sec24bQ80ZX0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sec24bQ80ZX0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sec24bQ80ZX0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sec24bQ80ZX0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sec24bQ80ZX0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sec24bQ80ZX0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sec24bQ80ZX0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sec24bQ80ZX0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sec24bQ80ZX0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sec24bQ80ZX0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sec24bQ80ZX0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sec24bQ80ZX0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sec24bQ80ZX0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sec24bQ80ZX0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms