RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C HEH2Q03281 663 aa4.69□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data4.69□□□□□ -1.66not detected
SUP53tL(CAA)C SPH1Q06160 661 aa4.69□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C CSC1Q06538 782 aa4.69□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C LAA1P39526 2014 aa4.68□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C CYB2P00175 591 aa4.68□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C MCR1P36060 302 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C YHL050CP38721 697 aa4.68□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C SOL4P53315 255 aa4.68□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C PIF1P07271 859 aa4.67□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C BET2P20133 325 aa4.67□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C IMG2P25642 146 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C MGA2P40578 1113 aa4.67□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C SAD1P43589 448 aa4.67□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C SPO74P45819 413 aa4.67□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C RPS7BP48164 190 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C BIO5P53744 561 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C MSC2Q03455 724 aa4.67□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C YPL260WQ08977 551 aa4.67□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C ACE2P21192 770 aa4.66□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C MCM3P24279 971 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C SUV3P32580 737 aa4.66□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C TIM23P32897 222 aa4.66□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C KTR3P38130 404 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C HDA1P53973 706 aa4.66□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C SUE1Q06524 206 aa4.66□□□□□ -1.66
SUP53tL(CAA)C SNA3P14359 133 aa4.65□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C NDT80P38830 627 aa4.65□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C ALD5P40047 520 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C CSI1Q04368 295 aa4.65□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C CSF1Q12150 2958 aa4.65□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C SLX1P38324 304 aa4.64□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C UBP9P39967 754 aa4.64□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C YJL045WP47052 634 aa4.64□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C SPO71Q03868 1245 aa4.64□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C RKM4Q12504 494 aa4.64□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C TRA1P38811 3744 aa4.64□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C MSD1P15179 658 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C KIN82P25341 720 aa4.63□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C PRO3P32263 286 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C RFS1P38234 210 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C VID27P40157 782 aa4.63□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C SKY1Q03656 742 aa4.63□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C MFB1Q04922 465 aa4.63□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C PIG1Q06216 648 aa4.63□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C ISW2Q08773 1120 aa4.63□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C PRP8P33334 2413 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C TRP2P00899 507 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C PUP3P25451 205 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C FUB1P25659 250 aa4.62□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C SEG2P34250 1132 aa4.62□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C APM2P38700 605 aa4.62□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C YPP1P46951 817 aa4.62□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C ESF1Q06344 628 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C MAG2Q06436 670 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C HCM1P25364 564 aa4.61□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C COQ8P27697 501 aa4.61□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C SEC8P32855 1065 aa4.61□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C DRE2P36152 348 aa4.61□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C YMR147WP40218 223 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C YFL052WP43551 465 aa4.61□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C KAR5Q04746 504 aa4.61□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C YLR455WQ06188 304 aa4.61□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C YRR1Q12172 810 aa4.61□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C CHO2P05374 869 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C SNF1P06782 633 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C PEX1P24004 1043 aa4.6□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C CCC2P38995 1004 aa4.6□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C MMR1Q06324 491 aa4.6□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C UTP4Q06679 776 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C RRD2Q12461 358 aa4.6□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C RAD61Q99359 647 aa4.6□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C ADK2P26364 225 aa4.59□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C GCS1P35197 352 aa4.59□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C YIR016WP40572 265 aa4.59□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C MAF1P41910 395 aa4.59□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C ZAP1P47043 880 aa4.59□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C CAF120P53836 1060 aa4.59□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C PML39Q03760 334 aa4.59□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C HCR1Q05775 265 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SUP53tL(CAA)C MSB2P32334 1306 aa4.58□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C RPS19AP07280 144 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C APE1P14904 514 aa4.58□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C COQ1P18900 473 aa4.58□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C APN2P38207 520 aa4.58□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C RTS1P38903 757 aa4.58□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C MOB1P40484 314 aa4.58□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C EPS1P40557 701 aa4.58□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C MUK1Q02866 612 aa4.58□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C SPP1Q03012 353 aa4.58□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C PEX19Q07418 342 aa4.58□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C YDL144CQ07589 356 aa4.58□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C AFT1P22149 690 aa4.57□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C SMY2P32909 740 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SUP53tL(CAA)C IOC3P43596 787 aa4.57□□□□□ -1.68
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