RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607330.1

MEIS3-213, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 4

Gene MEIS3, Length 515 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-213ENST00000607330 PDE3BQ13370 1112 aa24.37■■□□□ 1.49
MEIS3-213ENST00000607330 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.37■■□□□ 1.49
MEIS3-213ENST00000607330 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
MEIS3-213ENST00000607330 BCL9O00512 1426 aa24.35■■□□□ 1.49
MEIS3-213ENST00000607330 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.35■■□□□ 1.49
MEIS3-213ENST00000607330 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
MEIS3-213ENST00000607330 FCHSD2O94868 740 aa24.33■■□□□ 1.49
MEIS3-213ENST00000607330 HMOX1P09601 288 aa24.33■■□□□ 1.49
MEIS3-213ENST00000607330 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
MEIS3-213ENST00000607330 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
MEIS3-213ENST00000607330 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-213ENST00000607330 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-213ENST00000607330 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-213ENST00000607330 SPG7Q9UQ90 795 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-213ENST00000607330 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-213ENST00000607330 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.32■■□□□ 1.48
MEIS3-213ENST00000607330 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.31■■□□□ 1.48
MEIS3-213ENST00000607330 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
MEIS3-213ENST00000607330 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.29■■□□□ 1.48
MEIS3-213ENST00000607330 CCDC184Q52MB2 194 aa24.28■■□□□ 1.48
MEIS3-213ENST00000607330 CYP27B1O15528 508 aa24.27■■□□□ 1.48
MEIS3-213ENST00000607330 PRKAR2BP31323 418 aa24.26■■□□□ 1.47
MEIS3-213ENST00000607330 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
MEIS3-213ENST00000607330 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.25■■□□□ 1.47
MEIS3-213ENST00000607330 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
MEIS3-213ENST00000607330 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
MEIS3-213ENST00000607330 MRS2Q9HD23 443 aa24.25■■□□□ 1.47
MEIS3-213ENST00000607330 FAM182BQ5T319 152 aa24.24■■□□□ 1.47
MEIS3-213ENST00000607330 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.24■■□□□ 1.47
MEIS3-213ENST00000607330 PHKG2P15735 406 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-213ENST00000607330 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS3-213ENST00000607330 CCER2I3L3R5 266 aa24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-213ENST00000607330 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
MEIS3-213ENST00000607330 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-213ENST00000607330 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-213ENST00000607330 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-213ENST00000607330 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.21■■□□□ 1.47
MEIS3-213ENST00000607330 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-213ENST00000607330 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.2■■□□□ 1.46
MEIS3-213ENST00000607330 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.19■■□□□ 1.46
MEIS3-213ENST00000607330 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-213ENST00000607330 CCDC125Q86Z20 511 aa24.18■■□□□ 1.46
MEIS3-213ENST00000607330 DCAF5Q96JK2 942 aa24.17■■□□□ 1.46
MEIS3-213ENST00000607330 NEFMP07197 916 aa24.16■■□□□ 1.46
MEIS3-213ENST00000607330 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
MEIS3-213ENST00000607330 NHSQ6T4R5 1651 aa24.15■■□□□ 1.46
MEIS3-213ENST00000607330 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
MEIS3-213ENST00000607330 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.14■■□□□ 1.46
MEIS3-213ENST00000607330 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 RUNDC1Q96C34 613 aa24.14■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 EP400Q96L91 3159 aa24.14■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 SBF2Q86WG5 1849 aa24.13■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 MIER1Q8N108 512 aa24.13■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.13■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 MAP3K5Q99683 1374 aa24.13■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 SOCS7O14512 581 aa24.12■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 TRIM37O94972 964 aa24.12■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.12■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.12■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.11■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.11■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 KCNQ2O43526 872 aa24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 NFE2L2Q16236 605 aa24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.1■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.09■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 MRC1P22897 1456 aa24.08■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.08■■□□□ 1.45
MEIS3-213ENST00000607330 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.07■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.07■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 LGR6Q9HBX8 967 aa24.05■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.05■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 PLSCR1O15162 318 aa24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 IL17REQ8NFR9 667 aa24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.03■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 APBA3O96018 575 aa24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 BAG6P46379 1132 aa24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 CABP4P57796 275 aa24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 PIGBQ92521 554 aa24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-213ENST00000607330 BTAF1O14981 1849 aa24.01■■□□□ 1.43
MEIS3-213ENST00000607330 RIPK4P57078 832 aa24.01■■□□□ 1.43
MEIS3-213ENST00000607330 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.01■■□□□ 1.43
MEIS3-213ENST00000607330 ITGB4P16144 1822 aa24■■□□□ 1.43
MEIS3-213ENST00000607330 APAF1O14727 1248 aa24■■□□□ 1.43
MEIS3-213ENST00000607330 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.99■■□□□ 1.43
MEIS3-213ENST00000607330 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.98■■□□□ 1.43
MEIS3-213ENST00000607330 MCM10Q7L590 875 aa23.97■■□□□ 1.43
MEIS3-213ENST00000607330 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.97■■□□□ 1.43
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