RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592316.1

APLP1-211, Transcript of amyloid beta precursor like protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene APLP1, Length 1,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP1-211ENST00000592316 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.53■■□□□ 1.36
APLP1-211ENST00000592316 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
APLP1-211ENST00000592316 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
APLP1-211ENST00000592316 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
APLP1-211ENST00000592316 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
APLP1-211ENST00000592316 SYT17Q9BSW7 474 aa23.51■■□□□ 1.35
APLP1-211ENST00000592316 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
APLP1-211ENST00000592316 PLSCR1O15162 318 aa23.5■■□□□ 1.35
APLP1-211ENST00000592316 CEP350Q5VT06 3117 aa23.49■■□□□ 1.35
APLP1-211ENST00000592316 COL18A1P39060 1754 aa23.48■■□□□ 1.35
APLP1-211ENST00000592316 FCHSD2O94868 740 aa23.48■■□□□ 1.35
APLP1-211ENST00000592316 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.47■■□□□ 1.35
APLP1-211ENST00000592316 NGEFQ8N5V2 710 aa23.47■■□□□ 1.35
APLP1-211ENST00000592316 PTGER2P43116 358 aa23.46■■□□□ 1.35
APLP1-211ENST00000592316 RUNDC1Q96C34 613 aa23.46■■□□□ 1.35
APLP1-211ENST00000592316 KIAA0232Q92628 1395 aa23.46■■□□□ 1.35
APLP1-211ENST00000592316 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.45■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.43■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 KDRP35968 1356 aa23.42■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 STRN4Q9NRL3 753 aa23.42■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.42■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.41■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 ZBTB7AO95365 584 aa23.41■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.41■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 MAP3K5Q99683 1374 aa23.4■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 NEFMP07197 916 aa23.39■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 EVA1CP58658 441 aa23.39■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 NCAPD2Q15021 1401 aa23.39■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.39■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 EYA1Q99502 592 aa23.39■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 USP35Q9P2H5 1018 aa23.39■■□□□ 1.34
APLP1-211ENST00000592316 ERBB3P21860 1342 aa23.39■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.39■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.38■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.38■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 MTFR1LQ9H019 292 aa23.38■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 RGPD5Q99666 1765 aa23.38■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.37■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.37■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 PRKAR2BP31323 418 aa23.36■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.36■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 APAF1O14727 1248 aa23.35■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 HMOX1P09601 288 aa23.35■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 ADRA2BP18089 450 aa23.35■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 SBF2Q86WG5 1849 aa23.35■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 NEFLP07196 543 aa23.34■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 CHRNA2Q15822 529 aa23.34■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.34■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 GPR162Q16538 588 aa23.33■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 STK32BQ9NY57 414 aa23.33■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
APLP1-211ENST00000592316 CCDC27Q2M243 656 aa23.33■■□□□ 1.32
APLP1-211ENST00000592316 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.33■■□□□ 1.32
APLP1-211ENST00000592316 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.32■■□□□ 1.32
APLP1-211ENST00000592316 NBPF4Q96M43 638 aa23.32■■□□□ 1.32
APLP1-211ENST00000592316 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
APLP1-211ENST00000592316 ARXQ96QS3 562 aa23.31■■□□□ 1.32
APLP1-211ENST00000592316 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.31■■□□□ 1.32
APLP1-211ENST00000592316 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.3■■□□□ 1.32
APLP1-211ENST00000592316 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.3■■□□□ 1.32
APLP1-211ENST00000592316 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
APLP1-211ENST00000592316 ZNF521Q96K83 1311 aa23.29■■□□□ 1.32
APLP1-211ENST00000592316 SLC15A2Q16348 729 aa23.29■■□□□ 1.32
APLP1-211ENST00000592316 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.28■■□□□ 1.32
APLP1-211ENST00000592316 NFE2L2Q16236 605 aa23.28■■□□□ 1.32
APLP1-211ENST00000592316 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.26■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.26■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 HSPA6P17066 643 aa23.25■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.25■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.25■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.24■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 WWC1Q8IX03 1113 aa23.23■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 PROM2Q8N271 834 aa23.23■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.23■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 BCL9O00512 1426 aa23.22■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 CRB1P82279 1406 aa23.22■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 RIPK4P57078 832 aa23.22■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 WDR63Q8IWG1 891 aa23.22■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.22■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.21■■□□□ 1.31
APLP1-211ENST00000592316 GOLGA2Q08379 1002 aa23.2■■□□□ 1.3
APLP1-211ENST00000592316 NEUROD2Q15784 382 aa23.2■■□□□ 1.3
APLP1-211ENST00000592316 DDB1Q16531 1140 aa23.2■■□□□ 1.3
APLP1-211ENST00000592316 TXNRD1Q16881 649 aa23.2■■□□□ 1.3
APLP1-211ENST00000592316 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.2■■□□□ 1.3
APLP1-211ENST00000592316 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms