RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.65■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 RLBP1P12271 317 aa28.65■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.65■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 TRIM27P14373 513 aa28.64■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.63■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.62■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.61■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 TSPYL6Q8N831 410 aa28.61■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 NBPF4Q96M43 638 aa28.61■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.61■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.6■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 MAP3K5Q99683 1374 aa28.6■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.6■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 NCAPD2Q15021 1401 aa28.59■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 PXDNQ92626 1479 aa28.59■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 TNNQ9UQP3 1299 aa28.59■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.58■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.57■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 BRINP3Q76B58 766 aa28.56■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.55■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.55■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 LRRC37A3O60309 1634 aa28.55■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 ABCC6O95255 1503 aa28.55■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 SLAIN2Q9P270 581 aa28.55■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.55■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.53■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.52■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 ERBB3P21860 1342 aa28.5■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.5■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.5■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 PLEKHG5O94827 1062 aa28.49■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 IL17REQ8NFR9 667 aa28.49■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.49■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 CPDO75976 1380 aa28.48■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 IGHDP01880 384 aa28.47■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.47■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa28.47■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.47■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.46■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 ABCC4O15439 1325 aa28.45■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.45■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.44■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.43■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.43■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 PTPRCP08575 1304 aa28.43■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 COL18A1P39060 1754 aa28.42■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.42■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.42■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 RGPD5Q99666 1765 aa28.41■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 KRT24Q2M2I5 525 aa28.41■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.4■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.39■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.37■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.133e-11■□□□□ 8.5
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USP36-218ENST00000590546 PDE4AP27815 886 aa28.36■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 TEFQ10587 303 aa28.36■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.36■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.36■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 STK31Q9BXU1 1019 aa28.35■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 SLC4A2P04920 1241 aa28.34■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.34■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 BACH2Q9BYV9 841 aa28.34■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.33■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 RNMTO43148 476 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 HOXB7P09629 217 aa28.32■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 LGR6Q9HBX8 967 aa28.32■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 SPG7Q9UQ90 795 aa28.32■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 CACNA1FO60840 1977 aa28.31■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 CHRNA2Q15822 529 aa28.3■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 RGS3P49796 1198 aa28.29■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.29■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.29■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 RGS12O14924 1447 aa28.29■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 SKAP1Q86WV1 359 aa28.28■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.28■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 BTBD11A6QL63 1104 aa28.27■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.26■■■□□ 2.11
USP36-218ENST00000590546 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
USP36-218ENST00000590546 SMC5Q8IY18 1101 aa28.26■■■□□ 2.11
USP36-218ENST00000590546 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.26■■■□□ 2.11
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