RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.65■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 RLBP1P12271 317 aa28.65■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.65■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 TRIM27P14373 513 aa28.64■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.63■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.62■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.61■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 TSPYL6Q8N831 410 aa28.61■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 NBPF4Q96M43 638 aa28.61■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.61■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.6■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 MAP3K5Q99683 1374 aa28.6■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.6■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 NCAPD2Q15021 1401 aa28.59■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 PXDNQ92626 1479 aa28.59■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 TNNQ9UQP3 1299 aa28.59■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.58■■■□□ 2.17
USP36-218ENST00000590546 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.57■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 BRINP3Q76B58 766 aa28.56■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.55■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.55■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 LRRC37A3O60309 1634 aa28.55■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 ABCC6O95255 1503 aa28.55■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 SLAIN2Q9P270 581 aa28.55■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.55■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.53■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.52■■■□□ 2.16
USP36-218ENST00000590546 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 ERBB3P21860 1342 aa28.5■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.5■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.5■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 PLEKHG5O94827 1062 aa28.49■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 IL17REQ8NFR9 667 aa28.49■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.49■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 CPDO75976 1380 aa28.48■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 IGHDP01880 384 aa28.47■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.47■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa28.47■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.47■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.46■■■□□ 2.15
USP36-218ENST00000590546 ABCC4O15439 1325 aa28.45■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.45■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.44■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.43■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.43■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 PTPRCP08575 1304 aa28.43■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 COL18A1P39060 1754 aa28.42■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.42■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.42■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 RGPD5Q99666 1765 aa28.41■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 KRT24Q2M2I5 525 aa28.41■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.4■■■□□ 2.14
USP36-218ENST00000590546 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.39■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.37■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.133e-11■□□□□ 8.5
USP36-218ENST00000590546 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 PDE4AP27815 886 aa28.36■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 TEFQ10587 303 aa28.36■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.36■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.36■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 STK31Q9BXU1 1019 aa28.35■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 SLC4A2P04920 1241 aa28.34■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.34■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 BACH2Q9BYV9 841 aa28.34■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.33■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
USP36-218ENST00000590546 RNMTO43148 476 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 HOXB7P09629 217 aa28.32■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 LGR6Q9HBX8 967 aa28.32■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 SPG7Q9UQ90 795 aa28.32■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 CACNA1FO60840 1977 aa28.31■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 CHRNA2Q15822 529 aa28.3■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 RGS3P49796 1198 aa28.29■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.29■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.29■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 RGS12O14924 1447 aa28.29■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 SKAP1Q86WV1 359 aa28.28■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.28■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 BTBD11A6QL63 1104 aa28.27■■■□□ 2.12
USP36-218ENST00000590546 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.26■■■□□ 2.11
USP36-218ENST00000590546 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
USP36-218ENST00000590546 SMC5Q8IY18 1101 aa28.26■■■□□ 2.11
USP36-218ENST00000590546 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms