RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 PTPN5P54829 565 aa8.47□□□□□ -1.05
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PIK3C3-211ENST00000589550 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
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PIK3C3-211ENST00000589550 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
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PIK3C3-211ENST00000589550 COL26A1Q96A83 441 aa8.43□□□□□ -1.06
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PIK3C3-211ENST00000589550 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
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PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF358Q9NW07 568 aa8.35□□□□□ -1.07
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PIK3C3-211ENST00000589550 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 28.8
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PIK3C3-211ENST00000589550 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.32□□□□□ -1.08
PIK3C3-211ENST00000589550 NDUFB5O43674 189 aa8.31□□□□□ -1.08
PIK3C3-211ENST00000589550 ERVK-9P63128 1117 aa8.31□□□□□ -1.08
PIK3C3-211ENST00000589550 SH3BP2P78314 561 aa8.31□□□□□ -1.08
PIK3C3-211ENST00000589550 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.31□□□□□ -1.08
PIK3C3-211ENST00000589550 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.31□□□□□ -1.08
PIK3C3-211ENST00000589550 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
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PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.3□□□□□ -1.08
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