RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589266.5

CIRBP-223, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 3

Gene CIRBP, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-223	ENST00000589266	SLC15A2	Q16348	729 aa		33.72	■■■□□ 2.99
CIRBP-223	ENST00000589266	MTHFS	P49914	203 aa		33.7	■■■□□ 2.99
CIRBP-223	ENST00000589266	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		33.7	■■■□□ 2.99
CIRBP-223	ENST00000589266	SYT17	Q9BSW7	474 aa		33.7	■■■□□ 2.99
CIRBP-223	ENST00000589266	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		33.7	■■■□□ 2.99
CIRBP-223	ENST00000589266	RTL1	A6NKG5	1358 aa		33.7	■■■□□ 2.98
CIRBP-223	ENST00000589266	SOX12	O15370	315 aa		33.69	■■■□□ 2.98
CIRBP-223	ENST00000589266	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		33.69	■■■□□ 2.98
CIRBP-223	ENST00000589266	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
CIRBP-223	ENST00000589266	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		33.69	■■■□□ 2.98
CIRBP-223	ENST00000589266	INSR	P06213	1382 aa		33.69	■■■□□ 2.98
CIRBP-223	ENST00000589266	UTRN	P46939	3433 aa		33.69	■■■□□ 2.98
CIRBP-223	ENST00000589266	ABCC6	O95255	1503 aa		33.69	■■■□□ 2.98
CIRBP-223	ENST00000589266	EXOC5	O00471	708 aa		33.68	■■■□□ 2.98
CIRBP-223	ENST00000589266	LTN1	O94822	1766 aa		33.67	■■■□□ 2.98
CIRBP-223	ENST00000589266	FBLN1	P23142	703 aa		33.67	■■■□□ 2.98
CIRBP-223	ENST00000589266	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
CIRBP-223	ENST00000589266	MTFR1L	Q9H019	292 aa		33.67	■■■□□ 2.98
CIRBP-223	ENST00000589266	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		33.66	■■■□□ 2.98
CIRBP-223	ENST00000589266	FLT4	P35916	1363 aa		33.65	■■■□□ 2.98
CIRBP-223	ENST00000589266	CFAP53	Q96M91	514 aa		33.65	■■■□□ 2.98
CIRBP-223	ENST00000589266	RGPD5	Q99666	1765 aa		33.63	■■■□□ 2.97
CIRBP-223	ENST00000589266	CHD4	Q14839	1912 aa		33.62	■■■□□ 2.97
CIRBP-223	ENST00000589266	AMPH	P49418	695 aa		33.62	■■■□□ 2.97
CIRBP-223	ENST00000589266	IP6K1	Q92551	441 aa		33.61	■■■□□ 2.97
CIRBP-223	ENST00000589266	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		33.6	■■■□□ 2.97
CIRBP-223	ENST00000589266	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
CIRBP-223	ENST00000589266	HOXC9	P31274	260 aa		33.58	■■■□□ 2.97
CIRBP-223	ENST00000589266	MRS2	Q9HD23	443 aa		33.57	■■■□□ 2.96
CIRBP-223	ENST00000589266	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	33.56	■■■□□ 2.96
CIRBP-223	ENST00000589266	ARX	Q96QS3	562 aa		33.56	■■■□□ 2.96
CIRBP-223	ENST00000589266	TNS2	Q63HR2	1409 aa		33.53	■■■□□ 2.96
CIRBP-223	ENST00000589266	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		33.53	■■■□□ 2.96
CIRBP-223	ENST00000589266	CCDC184	Q52MB2	194 aa		33.52	■■■□□ 2.96
CIRBP-223	ENST00000589266	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		33.52	■■■□□ 2.96
CIRBP-223	ENST00000589266	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	33.51	■■■□□ 2.95
CIRBP-223	ENST00000589266	C1QTNF8	P60827	252 aa		33.51	■■■□□ 2.95
CIRBP-223	ENST00000589266	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		33.51	■■■□□ 2.95
CIRBP-223	ENST00000589266	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		33.5	■■■□□ 2.95
CIRBP-223	ENST00000589266	NHS	Q6T4R5	1651 aa		33.5	■■■□□ 2.95
CIRBP-223	ENST00000589266	NUDC	Q9Y266	331 aa		33.49	■■■□□ 2.95
CIRBP-223	ENST00000589266	MAP3K5	Q99683	1374 aa		33.48	■■■□□ 2.95
CIRBP-223	ENST00000589266	IL13	P35225	146 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CIRBP-223	ENST00000589266	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
CIRBP-223	ENST00000589266	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
CIRBP-223	ENST00000589266	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CIRBP-223	ENST00000589266	GPR162	Q16538	588 aa		33.43	■■■□□ 2.94
CIRBP-223	ENST00000589266	PAPPA	Q13219	1627 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CIRBP-223	ENST00000589266	IL2RB	P14784	551 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CIRBP-223	ENST00000589266	ERBB3	P21860	1342 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CIRBP-223	ENST00000589266	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
CIRBP-223	ENST00000589266	ZNF827	Q17R98	1081 aa		33.4	■■■□□ 2.94
CIRBP-223	ENST00000589266	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		33.4	■■■□□ 2.94
CIRBP-223	ENST00000589266	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	33.39	■■■□□ 2.94
CIRBP-223	ENST00000589266	BTAF1	O14981	1849 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CIRBP-223	ENST00000589266	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		33.37	■■■□□ 2.93
CIRBP-223	ENST00000589266	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		33.37	■■■□□ 2.93
CIRBP-223	ENST00000589266	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CIRBP-223	ENST00000589266	POLD1	P28340	1107 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CIRBP-223	ENST00000589266	KLHL34	Q8N239	644 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CIRBP-223	ENST00000589266	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
CIRBP-223	ENST00000589266	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
CIRBP-223	ENST00000589266	NCAPD2	Q15021	1401 aa		33.32	■■■□□ 2.92
CIRBP-223	ENST00000589266	AKT1S1	Q96B36	256 aa		33.32	■■■□□ 2.92
CIRBP-223	ENST00000589266	EYA1	Q99502	592 aa		33.32	■■■□□ 2.92
CIRBP-223	ENST00000589266	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
CIRBP-223	ENST00000589266	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
CIRBP-223	ENST00000589266	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	33.31	■■■□□ 2.92
CIRBP-223	ENST00000589266	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		33.31	■■■□□ 2.92
CIRBP-223	ENST00000589266	FCHSD2	O94868	740 aa		33.29	■■■□□ 2.92
CIRBP-223	ENST00000589266	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
CIRBP-223	ENST00000589266	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		33.29	■■■□□ 2.92
CIRBP-223	ENST00000589266	KDR	P35968	1356 aa		33.29	■■■□□ 2.92
CIRBP-223	ENST00000589266	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
CIRBP-223	ENST00000589266	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		33.27	■■■□□ 2.92
CIRBP-223	ENST00000589266	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		33.27	■■■□□ 2.92
CIRBP-223	ENST00000589266	NBPF4	Q96M43	638 aa		33.27	■■■□□ 2.92
CIRBP-223	ENST00000589266	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		33.25	■■■□□ 2.91
CIRBP-223	ENST00000589266	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
CIRBP-223	ENST00000589266	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		33.24	■■■□□ 2.91
CIRBP-223	ENST00000589266	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
CIRBP-223	ENST00000589266	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		33.24	■■■□□ 2.91
CIRBP-223	ENST00000589266	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		33.24	■■■□□ 2.91
CIRBP-223	ENST00000589266	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.23	■■■□□ 2.91
CIRBP-223	ENST00000589266	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.23	■■■□□ 2.91
CIRBP-223	ENST00000589266	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		33.22	■■■□□ 2.91
CIRBP-223	ENST00000589266	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		33.22	■■■□□ 2.91
CIRBP-223	ENST00000589266	HMOX1	P09601	288 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CIRBP-223	ENST00000589266	IFFO2	Q5TF58	517 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CIRBP-223	ENST00000589266	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CIRBP-223	ENST00000589266	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CIRBP-223	ENST00000589266	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
CIRBP-223	ENST00000589266	GRIN3B	O60391	1043 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CIRBP-223	ENST00000589266	KCNQ4	P56696	695 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CIRBP-223	ENST00000589266	RUNDC1	Q96C34	613 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CIRBP-223	ENST00000589266	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CIRBP-223	ENST00000589266	CEP350	Q5VT06	3117 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CIRBP-223	ENST00000589266	NEFM	P07197	916 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CIRBP-223	ENST00000589266	PRKAR2B	P31323	418 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CIRBP-223	ENST00000589266	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9

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