RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-204ENST00000559861 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-204ENST00000559861 SOX11P35716 441 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-204ENST00000559861 DISP1Q96F81 1524 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-204ENST00000559861 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-204ENST00000559861 POM121CA8CG34 1229 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-204ENST00000559861 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARID5BQ14865 1188 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-204ENST00000559861 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTPRGP23470 1445 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALDH1A1P00352 501 aa14.91□□□□□ -0.02
USP3-AS1-204ENST00000559861 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
USP3-AS1-204ENST00000559861 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-204ENST00000559861 GRM5P41594 1212 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-204ENST00000559861 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIAA0556O60303 1618 aa14.89□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 J3QL48 77 aa14.89□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 GFRA3O60609 400 aa14.89□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADH1CP00326 375 aa14.89□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.89□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.88□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMPD1P17405 629 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 SEMA3FQ13275 785 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALG2Q9H553 416 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 UACAQ9BZF9 1416 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 LAPTM4AQ15012 233 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 ESPNB1AK53 854 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 NR5A1Q13285 461 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 WASF2Q9Y6W5 498 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 FSHRP23945 695 aa14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.82□□□□□ -0.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.82□□□□□ -0.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.81□□□□□ -0.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 GLMNQ92990 594 aa14.81□□□□□ -0.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 NR3C2P08235 984 aa14.8□□□□□ -0.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 NNTQ13423 1086 aa14.8□□□□□ -0.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.8□□□□□ -0.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM187AA6NFU0 413 aa14.79□□□□□ -0.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF20Q5VTR2 975 aa14.78□□□□□ -0.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIF21BO75037 1637 aa14.77□□□□□ -0.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 DGAT1O75907 488 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC125Q86Z20 511 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC116Q8IYX3 515 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 HPS1Q92902 700 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABCA8O94911 1581 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 AVPP01185 164 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAB15P59190 212 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 PKDCCQ504Y2 493 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF135Q8IUD6 432 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 UCN2Q96RP3 112 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-204ENST00000559861 PIK3CDO00329 1044 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARID3CA6NKF2 412 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 TIMP2P16035 220 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 ITPKCQ96DU7 683 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZFAND3Q9H8U3 227 aa14.65□□□□□ -0.06
USP3-AS1-204ENST00000559861 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYT1Q01538 1121 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.64□□□□□ -0.07
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIM52Q96A61 297 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms